Species

Sampling: 88 out of 222 species have genetic data (in bold)

Species list
  • Brachymystax lenok
  • Brachymystax savinovi
  • Brachymystax tumensis
  • Coregonus albula
  • Coregonus autumnalis
  • Coregonus baerii
  • Coregonus baicalensis
  • Coregonus baunti
  • Coregonus chadary
  • Coregonus clupeaformis
  • Coregonus hoyi
  • Coregonus huntsmani
  • Coregonus kiyi
  • Coregonus laurettae
  • Coregonus lavaretus
  • Coregonus migratorius
  • Coregonus muksun
  • Coregonus nasus
  • Coregonus nigripinnis
  • Coregonus oxyrinchus
  • Coregonus peled
  • Coregonus pidschian
  • Coregonus pollan
  • Coregonus pravdinellus
  • Coregonus sardinella
  • Coregonus tugun tugun
  • Coregonus ussuriensis
  • Coregonus zenithicus
  • Hucho bleekeri
  • Hucho hucho
  • Hucho perryi
  • Hucho taimen
  • Oncorhynchus apache
  • Oncorhynchus chrysogaster
  • Oncorhynchus clarkii
  • Oncorhynchus gilae
  • Oncorhynchus gorbuscha
  • Oncorhynchus keta
  • Oncorhynchus kisutch
  • Oncorhynchus masou formosanus
  • Oncorhynchus masou masou
  • Oncorhynchus mykiss
  • Oncorhynchus nerka
  • Oncorhynchus rhodurus
  • Oncorhynchus tshawytscha
  • Prosopium abyssicola
  • Prosopium coulterii
  • Prosopium cylindraceum
  • Prosopium gemmifer
  • Prosopium spilonotus
  • Prosopium williamsoni
  • Salmo carpio
  • Salmo labrax
  • Salmo macrostigma
  • Salmo marmoratus
  • Salmo obtusirostris
  • Salmo ohridanus
  • Salmo platycephalus
  • Salmo salar
  • Salmo trutta
  • Salvelinus albus
  • Salvelinus alpinus alpinus
  • Salvelinus boganidae
  • Salvelinus confluentus
  • Salvelinus curilus
  • Salvelinus drjagini
  • Salvelinus elgyticus
  • Salvelinus fontinalis
  • Salvelinus kronocius
  • Salvelinus kuznetzovi
  • Salvelinus leucomaenis imbrius
  • Salvelinus leucomaenis leucomaenis
  • Salvelinus leucomaenis pluvius
  • Salvelinus levanidovi
  • Salvelinus malma
  • Salvelinus namaycush
  • Salvelinus neiva
  • Salvelinus schmidti
  • Salvelinus taranetzi
  • Salvethymus svetovidovi
  • Stenodus leucichthys
  • Thymallus arcticus
  • Thymallus baicalensis
  • Thymallus brevirostris
  • Thymallus grubii flavomaculatus
  • Thymallus grubii grubii
  • Thymallus thymallus
  • Thymallus tugarinae
  • Coregonus albellus
  • Coregonus alpenae
  • Coregonus alpinus
  • Coregonus anaulorum
  • Coregonus arenicolus
  • Coregonus artedi
  • Coregonus atterensis
  • Coregonus austriacus
  • Coregonus bavaricus
  • Coregonus bezola
  • Coregonus candidus
  • Coregonus clupeoides
  • Coregonus confusus
  • Coregonus danneri
  • Coregonus duplex
  • Coregonus fatioi
  • Coregonus fera
  • Coregonus fontanae
  • Coregonus gutturosus
  • Coregonus heglingus
  • Coregonus hiemalis
  • Coregonus hoferi
  • Coregonus holsata
  • Coregonus johannae
  • Coregonus kiletz
  • Coregonus ladogae
  • Coregonus lucinensis
  • Coregonus lutokka
  • Coregonus macrophthalmus
  • Coregonus maraena
  • Coregonus maraenoides
  • Coregonus maxillaris
  • Coregonus megalops
  • Coregonus nelsonii
  • Coregonus nilssoni
  • Coregonus nipigon
  • Coregonus nobilis
  • Coregonus palaea
  • Coregonus pallasii
  • Coregonus pennantii
  • Coregonus reighardi
  • Coregonus renke
  • Coregonus restrictus
  • Coregonus stigmaticus
  • Coregonus subautumnalis
  • Coregonus suidteri
  • Coregonus trybomi
  • Coregonus tugun lenensis
  • Coregonus vandesius
  • Coregonus vessicus
  • Coregonus wartmanni
  • Coregonus widegreni
  • Coregonus zuerichensis
  • Coregonus zugensis
  • Hucho ishikawae
  • Oncorhynchus aguabonita
  • Oncorhynchus iwame
  • Oncorhynchus kawamurae
  • Oncorhynchus masou macrostomus
  • Salmo abanticus
  • Salmo akairos
  • Salmo aphelios
  • Salmo balcanicus
  • Salmo caspius
  • Salmo cenerinus
  • Salmo cettii
  • Salmo ciscaucasicus
  • Salmo coruhensis
  • Salmo dentex
  • Salmo ezenami
  • Salmo farioides
  • Salmo ferox
  • Salmo fibreni
  • Salmo ischchan
  • Salmo letnica
  • Salmo lourosensis
  • Salmo lumi
  • Salmo macedonicus
  • Salmo montenigrinus
  • Salmo nigripinnis
  • Salmo pallaryi
  • Salmo pelagonicus
  • Salmo peristericus
  • Salmo rhodanensis
  • Salmo rizeensis
  • Salmo schiefermuelleri
  • Salmo stomachicus
  • Salmo taleri
  • Salmo tigridis
  • Salmo visovacensis
  • Salmo zrmanjaensis
  • Salvelinus agassizii
  • Salvelinus alpinus erythrinus
  • Salvelinus anaktuvukensis
  • Salvelinus andriashevi
  • Salvelinus colii
  • Salvelinus czerskii
  • Salvelinus evasus
  • Salvelinus faroensis
  • Salvelinus fimbriatus
  • Salvelinus gracillimus
  • Salvelinus grayi
  • Salvelinus gritzenkoi
  • Salvelinus inframundus
  • Salvelinus jacuticus
  • Salvelinus japonicus
  • Salvelinus killinensis
  • Salvelinus krogiusae
  • Salvelinus lepechini
  • Salvelinus lonsdalii
  • Salvelinus mallochi
  • Salvelinus maxillaris
  • Salvelinus murta
  • Salvelinus neocomensis
  • Salvelinus obtusus
  • Salvelinus perisii
  • Salvelinus profundus
  • Salvelinus salvelinoinsularis
  • Salvelinus struanensis
  • Salvelinus taimyricus
  • Salvelinus thingvallensis
  • Salvelinus tolmachoffi
  • Salvelinus umbla
  • Salvelinus vasiljevae
  • Salvelinus willoughbii
  • Salvelinus youngeri
  • Stenodus nelma
  • Thymallus brevipinnis
  • Thymallus burejensis
  • Thymallus mertensii
  • Thymallus nigrescens
  • Thymallus pallasii
  • Thymallus svetovidovi
  • Thymallus yaluensis

Fossil calibrations

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Taxonomy

Class
Actinopteri
Subclass
Neopterygii
Infraclass
Teleostei
Megacohort
Osteoglossocephalai
Supercohort
Clupeocephala
Cohort
Euteleosteomorpha
Subcohort
Protacanthopterygii
Order
Salmoniformes
Family
Salmonidae

Downloads

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Phylogenies

Phylogram of Salmonidae

Time-calibrated phylogeny of Salmonidae

Sequence data

Phylip sequences for Salmonidae

RAxML-style partitions file

Nexus file for Salmonidae (includes character partitions and phylogeny)