Lutjanidae
75 of 133 species (56%) have genetic data.
Species
Largest genera
Sampled species out of the total in each genus:
- Lutjanus 43/70
- Pterocaesio 6/12
- Pristipomoides 6/11
- Caesio 5/9
- Paracaesio 2/8
All species
Species with genetic data are in bold.
Species list
- Aphareus furca
- Aphareus rutilans
- Aprion virescens
- Apsilus dentatus
- Caesio caerulaurea
- Caesio lunaris
- Caesio teres
- Caesio varilineata
- Caesio xanthonota
- Dipterygonotus balteatus
- Etelis coruscans
- Etelis oculatus
- Gymnocaesio gymnoptera
- Lutjanus adetii
- Lutjanus analis
- Lutjanus apodus
- Lutjanus argentimaculatus
- Lutjanus argentiventris
- Lutjanus bengalensis
- Lutjanus biguttatus
- Lutjanus bohar
- Lutjanus buccanella
- Lutjanus campechanus
- Lutjanus carponotatus
- Lutjanus colorado
- Lutjanus cyanopterus
- Lutjanus decussatus
- Lutjanus dentatus
- Lutjanus ehrenbergii
- Lutjanus erythropterus
- Lutjanus fulviflamma
- Lutjanus fulvus
- Lutjanus gibbus
- Lutjanus griseus
- Lutjanus jocu
- Lutjanus johnii
- Lutjanus kasmira
- Lutjanus lutjanus
- Lutjanus madras
- Lutjanus mahogoni
- Lutjanus malabaricus
- Lutjanus monostigma
- Lutjanus notatus
- Lutjanus novemfasciatus
- Lutjanus ophuysenii
- Lutjanus peru
- Lutjanus purpureus
- Lutjanus quinquelineatus
- Lutjanus rivulatus
- Lutjanus russellii
- Lutjanus sanguineus
- Lutjanus sebae
- Lutjanus stellatus
- Lutjanus synagris
- Lutjanus vitta
- Lutjanus vivanus
- Macolor niger
- Ocyurus chrysurus
- Paracaesio sordida
- Paracaesio xanthura
- Pristipomoides aquilonaris
- Pristipomoides auricilla
- Pristipomoides filamentosus
- Pristipomoides multidens
- Pristipomoides sieboldii
- Pristipomoides typus
- Pterocaesio chrysozona
- Pterocaesio digramma
- Pterocaesio marri
- Pterocaesio pisang
- Pterocaesio tile
- Pterocaesio trilineata
- Rhomboplites aurorubens
- Symphorichthys spilurus
- Symphorus nematophorus
- Apsilus fuscus
- Caesio cuning
- Caesio striata
- Caesio suevica
- Caesio xanthalytos
- Etelis carbunculus
- Etelis radiosus
- Hoplopagrus guentherii
- Lipocheilus carnolabrum
- Lutjanus agennes
- Lutjanus alexandrei
- Lutjanus ambiguus
- Lutjanus aratus
- Lutjanus bitaeniatus
- Lutjanus boutton
- Lutjanus coeruleolineatus
- Lutjanus dodecacanthoides
- Lutjanus endecacanthus
- Lutjanus fulgens
- Lutjanus fuscescens
- Lutjanus goldiei
- Lutjanus goreensis
- Lutjanus guilcheri
- Lutjanus guttatus
- Lutjanus indicus
- Lutjanus inermis
- Lutjanus jordani
- Lutjanus lemniscatus
- Lutjanus lunulatus
- Lutjanus maxweberi
- Lutjanus mizenkoi
- Lutjanus papuensis
- Lutjanus rufolineatus
- Lutjanus semicinctus
- Lutjanus timoriensis
- Lutjanus viridis
- Macolor macularis
- Paracaesio caerulea
- Paracaesio gonzalesi
- Paracaesio kusakarii
- Paracaesio paragrapsimodon
- Paracaesio stonei
- Paracaesio waltervadi
- Parapristipomoides squamimaxillaris
- Pinjalo lewisi
- Pinjalo pinjalo
- Pristipomoides argyrogrammicus
- Pristipomoides flavipinnis
- Pristipomoides freemani
- Pristipomoides macrophthalmus
- Pristipomoides zonatus
- Pterocaesio capricornis
- Pterocaesio flavifasciata
- Pterocaesio lativittata
- Pterocaesio monikae
- Pterocaesio randalli
- Pterocaesio tessellata
- Randallichthys filamentosus
Gene coverage
Share of the 75 sampled species with data for each gene
| Gene | Species with data | % of sampled species |
|---|---|---|
| coi | 67 | 89% |
| cytb | 47 | 63% |
| 16s | 38 | 51% |
| rag1 | 24 | 32% |
| nd4 | 16 | 21% |
| plagl2 | 16 | 21% |
| rag2 | 15 | 20% |
| zic1 | 15 | 20% |
| tbr1 | 14 | 19% |
| ficd | 13 | 17% |
| kiaa1239 | 13 | 17% |
| sidkey | 13 | 17% |
| panx2 | 11 | 15% |
| 12s | 10 | 13% |
| ripk4 | 10 | 13% |
| ptr | 9 | 12% |
| myh6 | 7 | 9% |
| sh3px3 | 7 | 9% |
| vcpip | 7 | 9% |
| svep1 | 4 | 5% |
| enc1 | 3 | 4% |
| glyt | 3 | 4% |
| hoxc6a | 3 | 4% |
| rhodopsin | 3 | 4% |
| sreb2 | 1 | 1% |
| 4c4 | 0 | 0% |
| nd2 | 0 | 0% |
Fossil calibrations
No internal fossil calibrations are available for this group.
Downloads
These data are released under the CC0 1.0 public domain dedication; please cite us if you use them (License).
Download Lutjanidae data (JSON format)
Species list for Lutjanidae (CSV format)
Phylogenies
Sequence data
Phylip sequences for Lutjanidae
Nexus file for Lutjanidae (includes character partitions and phylogeny)