{
  "species": [
    "Alepocephalus agassizii",
    "Alepocephalus andersoni",
    "Alepocephalus antipodianus",
    "Alepocephalus asperifrons",
    "Alepocephalus australis",
    "Alepocephalus bairdii",
    "Alepocephalus bicolor",
    "Alepocephalus blanfordii",
    "Alepocephalus dentifer",
    "Alepocephalus fundulus",
    "Alepocephalus longiceps",
    "Alepocephalus longirostris",
    "Alepocephalus melas",
    "Alepocephalus owstoni",
    "Alepocephalus planifrons",
    "Alepocephalus productus",
    "Alepocephalus rostratus",
    "Alepocephalus tenebrosus",
    "Alepocephalus triangularis",
    "Alepocephalus umbriceps",
    "Asquamiceps caeruleus",
    "Asquamiceps hjorti",
    "Asquamiceps longmani",
    "Asquamiceps velaris",
    "Aulastomatomorpha phospherops",
    "Bajacalifornia aequatoris",
    "Bajacalifornia arcylepis",
    "Bajacalifornia burragei",
    "Bajacalifornia calcarata",
    "Bajacalifornia erimoensis",
    "Bajacalifornia megalops",
    "Bajacalifornia microstoma",
    "Bathylaco macrophthalmus",
    "Bathylaco nielseni",
    "Bathylaco nigricans",
    "Bathyprion danae",
    "Bathytroctes breviceps",
    "Bathytroctes elegans",
    "Bathytroctes inspector",
    "Bathytroctes macrognathus",
    "Bathytroctes macrolepis",
    "Bathytroctes michaelsarsi",
    "Bathytroctes microlepis",
    "Bathytroctes oligolepis",
    "Bathytroctes pappenheimi",
    "Bathytroctes squamosus",
    "Bathytroctes zugmayeri",
    "Conocara bertelseni",
    "Conocara fiolenti",
    "Conocara kreffti",
    "Conocara macropterum",
    "Conocara microlepis",
    "Conocara murrayi",
    "Conocara nigrum",
    "Conocara paxtoni",
    "Conocara salmoneum",
    "Conocara werneri",
    "Einara edentula",
    "Einara macrolepis",
    "Herwigia kreffti",
    "Leptoderma affinis",
    "Leptoderma lubricum",
    "Leptoderma macrophthalmum",
    "Leptoderma macrops",
    "Leptoderma retropinna",
    "Microphotolepis multipunctata",
    "Microphotolepis schmidti",
    "Mirognathus normani",
    "Narcetes erimelas",
    "Narcetes kamoharai",
    "Narcetes lloydi",
    "Narcetes stomias",
    "Narcetes wonderi",
    "Photostylus pycnopterus",
    "Rinoctes nasutus",
    "Rouleina attrita",
    "Rouleina danae",
    "Rouleina eucla",
    "Rouleina euryops",
    "Rouleina guentheri",
    "Rouleina livida",
    "Rouleina maderensis",
    "Rouleina nuda",
    "Rouleina squamilatera",
    "Rouleina watasei",
    "Talismania antillarum",
    "Talismania aphos",
    "Talismania bifurcata",
    "Talismania brachycephala",
    "Talismania bussingi",
    "Talismania filamentosa",
    "Talismania homoptera",
    "Talismania kotlyari",
    "Talismania longifilis",
    "Talismania mekistonema",
    "Talismania okinawensis",
    "Xenodermichthys copei",
    "Xenodermichthys nodulosus",
    "Leptochilichthys agassizii",
    "Leptochilichthys microlepis",
    "Leptochilichthys pinguis",
    "Barbantus curvifrons",
    "Barbantus elongatus",
    "Holtbyrnia anomala",
    "Holtbyrnia conocephala",
    "Holtbyrnia cyanocephala",
    "Holtbyrnia innesi",
    "Holtbyrnia intermedia",
    "Holtbyrnia laticauda",
    "Holtbyrnia latifrons",
    "Holtbyrnia macrops",
    "Holtbyrnia ophiocephala",
    "Matsuichthys aequipinnis",
    "Maulisia acuticeps",
    "Maulisia argipalla",
    "Maulisia isaacsi",
    "Maulisia mauli",
    "Maulisia microlepis",
    "Mentodus bythios",
    "Mentodus crassus",
    "Mentodus eubranchus",
    "Mentodus facilis",
    "Mentodus longirostris",
    "Mentodus mesalirus",
    "Mentodus perforatus",
    "Mentodus rostratus",
    "Mirorictus taningi",
    "Normichthys herringi",
    "Normichthys operosus",
    "Normichthys yahganorum",
    "Pectinantus parini",
    "Persparsia kopua",
    "Platytroctes apus",
    "Platytroctes mirus",
    "Sagamichthys abei",
    "Sagamichthys gracilis",
    "Sagamichthys schnakenbecki",
    "Searsia koefoedi",
    "Searsioides calvala",
    "Searsioides multispinus"
  ],
  "sampled_species": [
    "Alepocephalus agassizii",
    "Alepocephalus antipodianus",
    "Alepocephalus bairdii",
    "Alepocephalus bicolor",
    "Alepocephalus owstoni",
    "Alepocephalus tenebrosus",
    "Bajacalifornia burragei",
    "Bathylaco nigricans",
    "Rouleina attrita",
    "Talismania bifurcata",
    "Talismania longifilis",
    "Xenodermichthys copei",
    "Holtbyrnia anomala",
    "Holtbyrnia latifrons",
    "Holtbyrnia macrops",
    "Maulisia argipalla",
    "Maulisia mauli",
    "Maulisia microlepis",
    "Mirorictus taningi",
    "Normichthys operosus",
    "Sagamichthys abei",
    "Searsia koefoedi"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Alepocephalus andersoni",
    "Alepocephalus asperifrons",
    "Alepocephalus australis",
    "Alepocephalus blanfordii",
    "Alepocephalus dentifer",
    "Alepocephalus fundulus",
    "Alepocephalus longiceps",
    "Alepocephalus longirostris",
    "Alepocephalus melas",
    "Alepocephalus planifrons",
    "Alepocephalus productus",
    "Alepocephalus rostratus",
    "Alepocephalus triangularis",
    "Alepocephalus umbriceps",
    "Asquamiceps caeruleus",
    "Asquamiceps hjorti",
    "Asquamiceps longmani",
    "Asquamiceps velaris",
    "Aulastomatomorpha phospherops",
    "Bajacalifornia aequatoris",
    "Bajacalifornia arcylepis",
    "Bajacalifornia calcarata",
    "Bajacalifornia erimoensis",
    "Bajacalifornia megalops",
    "Bajacalifornia microstoma",
    "Bathylaco macrophthalmus",
    "Bathylaco nielseni",
    "Bathyprion danae",
    "Bathytroctes breviceps",
    "Bathytroctes elegans",
    "Bathytroctes inspector",
    "Bathytroctes macrognathus",
    "Bathytroctes macrolepis",
    "Bathytroctes michaelsarsi",
    "Bathytroctes microlepis",
    "Bathytroctes oligolepis",
    "Bathytroctes pappenheimi",
    "Bathytroctes squamosus",
    "Bathytroctes zugmayeri",
    "Conocara bertelseni",
    "Conocara fiolenti",
    "Conocara kreffti",
    "Conocara macropterum",
    "Conocara microlepis",
    "Conocara murrayi",
    "Conocara nigrum",
    "Conocara paxtoni",
    "Conocara salmoneum",
    "Conocara werneri",
    "Einara edentula",
    "Einara macrolepis",
    "Herwigia kreffti",
    "Leptoderma affinis",
    "Leptoderma lubricum",
    "Leptoderma macrophthalmum",
    "Leptoderma macrops",
    "Leptoderma retropinna",
    "Microphotolepis multipunctata",
    "Microphotolepis schmidti",
    "Mirognathus normani",
    "Narcetes erimelas",
    "Narcetes kamoharai",
    "Narcetes lloydi",
    "Narcetes stomias",
    "Narcetes wonderi",
    "Photostylus pycnopterus",
    "Rinoctes nasutus",
    "Rouleina danae",
    "Rouleina eucla",
    "Rouleina euryops",
    "Rouleina guentheri",
    "Rouleina livida",
    "Rouleina maderensis",
    "Rouleina nuda",
    "Rouleina squamilatera",
    "Rouleina watasei",
    "Talismania antillarum",
    "Talismania aphos",
    "Talismania brachycephala",
    "Talismania bussingi",
    "Talismania filamentosa",
    "Talismania homoptera",
    "Talismania kotlyari",
    "Talismania mekistonema",
    "Talismania okinawensis",
    "Xenodermichthys nodulosus",
    "Leptochilichthys agassizii",
    "Leptochilichthys microlepis",
    "Leptochilichthys pinguis",
    "Barbantus curvifrons",
    "Barbantus elongatus",
    "Holtbyrnia conocephala",
    "Holtbyrnia cyanocephala",
    "Holtbyrnia innesi",
    "Holtbyrnia intermedia",
    "Holtbyrnia laticauda",
    "Holtbyrnia ophiocephala",
    "Matsuichthys aequipinnis",
    "Maulisia acuticeps",
    "Maulisia isaacsi",
    "Mentodus bythios",
    "Mentodus crassus",
    "Mentodus eubranchus",
    "Mentodus facilis",
    "Mentodus longirostris",
    "Mentodus mesalirus",
    "Mentodus perforatus",
    "Mentodus rostratus",
    "Normichthys herringi",
    "Normichthys yahganorum",
    "Pectinantus parini",
    "Persparsia kopua",
    "Platytroctes apus",
    "Platytroctes mirus",
    "Sagamichthys gracilis",
    "Sagamichthys schnakenbecki",
    "Searsioides calvala",
    "Searsioides multispinus"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [],
    "16s": [
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Sagamichthys abei"
    ],
    "4c4": [],
    "coi": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus bairdii",
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Bajacalifornia burragei",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania bifurcata",
      "Xenodermichthys copei",
      "Holtbyrnia anomala",
      "Holtbyrnia latifrons",
      "Holtbyrnia macrops",
      "Maulisia argipalla",
      "Maulisia mauli",
      "Maulisia microlepis",
      "Mirorictus taningi",
      "Normichthys operosus",
      "Sagamichthys abei",
      "Searsia koefoedi"
    ],
    "cytb": [],
    "enc1": [],
    "ficd": [
      "Maulisia microlepis",
      "Sagamichthys abei"
    ],
    "glyt": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Bathylaco nigricans",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania longifilis",
      "Searsia koefoedi"
    ],
    "hoxc6a": [],
    "kiaa1239": [],
    "myh6": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Bathylaco nigricans",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania bifurcata",
      "Talismania longifilis",
      "Xenodermichthys copei",
      "Maulisia microlepis",
      "Normichthys operosus",
      "Sagamichthys abei",
      "Searsia koefoedi"
    ],
    "nd2": [],
    "nd4": [],
    "panx2": [
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Xenodermichthys copei",
      "Sagamichthys abei"
    ],
    "plagl2": [
      "Alepocephalus owstoni",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania longifilis",
      "Maulisia microlepis",
      "Normichthys operosus",
      "Sagamichthys abei"
    ],
    "ptr": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Bathylaco nigricans",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania longifilis",
      "Maulisia microlepis",
      "Normichthys operosus",
      "Searsia koefoedi"
    ],
    "rag1": [
      "Alepocephalus bicolor",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania longifilis",
      "Xenodermichthys copei",
      "Normichthys operosus",
      "Sagamichthys abei"
    ],
    "rag2": [],
    "rhodopsin": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus antipodianus",
      "Alepocephalus bicolor",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Talismania longifilis",
      "Sagamichthys abei"
    ],
    "ripk4": [],
    "sh3px3": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Bathylaco nigricans",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania bifurcata",
      "Talismania longifilis",
      "Xenodermichthys copei",
      "Maulisia microlepis",
      "Normichthys operosus",
      "Searsia koefoedi"
    ],
    "sidkey": [
      "Maulisia microlepis"
    ],
    "sreb2": [],
    "svep1": [],
    "tbr1": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Bathylaco nigricans",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania bifurcata",
      "Talismania longifilis",
      "Xenodermichthys copei",
      "Maulisia microlepis",
      "Normichthys operosus",
      "Sagamichthys abei",
      "Searsia koefoedi"
    ],
    "vcpip": [],
    "zic1": [
      "Alepocephalus agassizii",
      "Alepocephalus owstoni",
      "Alepocephalus tenebrosus",
      "Rouleina attrita",
      "Talismania bifurcata",
      "Talismania longifilis",
      "Xenodermichthys copei",
      "Maulisia microlepis",
      "Normichthys operosus",
      "Sagamichthys abei",
      "Searsia koefoedi"
    ]
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Otomorpha"
    ],
    "division": [],
    "family": [
      "Alepocephalidae",
      "Leptochilichthyidae",
      "Platytroctidae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Alepocephaliformes"
    ],
    "section": [],
    "series": [],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Alepocephali"
    ],
    "subdivision": [],
    "suborder": [],
    "subsection": [],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Alepocephalus agassizii": 0.161,
    "Alepocephalus antipodianus": 0.1857,
    "Alepocephalus bairdii": 0.1294,
    "Alepocephalus bicolor": 0.1438,
    "Alepocephalus owstoni": 0.1722,
    "Alepocephalus tenebrosus": 0.1713,
    "Bajacalifornia burragei": 0.0842,
    "Bathylaco nigricans": 0.0924,
    "Holtbyrnia anomala": 0.2384,
    "Holtbyrnia latifrons": 0.1242,
    "Holtbyrnia macrops": 0.1208,
    "Maulisia argipalla": 0.1563,
    "Maulisia mauli": 0.177,
    "Maulisia microlepis": 0.1184,
    "Mirorictus taningi": 0.0829,
    "Normichthys operosus": 0.1477,
    "Rouleina attrita": 0.1402,
    "Sagamichthys abei": 0.1239,
    "Searsia koefoedi": 0.2432,
    "Talismania bifurcata": 0.1812,
    "Talismania longifilis": 0.1845,
    "Xenodermichthys copei": 0.1399
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Alepocephalus agassizii": 0.2147,
    "Alepocephalus antipodianus": 0.2147,
    "Alepocephalus bairdii": 0.2147,
    "Alepocephalus bicolor": 0.2147,
    "Alepocephalus owstoni": 0.2147,
    "Alepocephalus tenebrosus": 0.2147,
    "Bajacalifornia burragei": 0.2147,
    "Bathylaco nigricans": 0.2147,
    "Holtbyrnia anomala": 0.2149,
    "Holtbyrnia latifrons": 0.2149,
    "Holtbyrnia macrops": 0.2149,
    "Maulisia argipalla": 0.2149,
    "Maulisia mauli": 0.2149,
    "Maulisia microlepis": 0.2149,
    "Mirorictus taningi": 0.2149,
    "Normichthys operosus": 0.2149,
    "Rouleina attrita": 0.2147,
    "Sagamichthys abei": 0.2149,
    "Searsia koefoedi": 0.2149,
    "Talismania bifurcata": 0.2147,
    "Talismania longifilis": 0.2147,
    "Xenodermichthys copei": 0.2147
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Alepocephalus agassizii": 0.1197,
    "Alepocephalus antipodianus": 0.1197,
    "Alepocephalus bairdii": 0.1197,
    "Alepocephalus bicolor": 0.1197,
    "Alepocephalus owstoni": 0.1197,
    "Alepocephalus tenebrosus": 0.1197,
    "Bajacalifornia burragei": 0.1197,
    "Bathylaco nigricans": 0.1197,
    "Holtbyrnia anomala": 0.1198,
    "Holtbyrnia latifrons": 0.1198,
    "Holtbyrnia macrops": 0.1198,
    "Maulisia argipalla": 0.1198,
    "Maulisia mauli": 0.1198,
    "Maulisia microlepis": 0.1198,
    "Mirorictus taningi": 0.1198,
    "Normichthys operosus": 0.1198,
    "Rouleina attrita": 0.1197,
    "Sagamichthys abei": 0.1198,
    "Searsia koefoedi": 0.1198,
    "Talismania bifurcata": 0.1197,
    "Talismania longifilis": 0.1197,
    "Xenodermichthys copei": 0.1197
  },
  "mean_dr": 0.1508,
  "mean_bamm_lambda": 0.2148,
  "mean_bamm_mu": 0.1198,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/subcohort/Alepocephali.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/subcohort/Alepocephali.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/subcohort/Alepocephali.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/subcohort/Alepocephali_phylogram.tre",
  "rogues": []
}