{
  "species": [
    "Achiroides leucorhynchos",
    "Achiroides melanorhynchus",
    "Aesopia cornuta",
    "Aseraggodes albidus",
    "Aseraggodes auroculus",
    "Aseraggodes bahamondei",
    "Aseraggodes beauforti",
    "Aseraggodes borehami",
    "Aseraggodes brevirostris",
    "Aseraggodes chapleaui",
    "Aseraggodes cheni",
    "Aseraggodes corymbus",
    "Aseraggodes crypticus",
    "Aseraggodes cyaneus",
    "Aseraggodes cyclurus",
    "Aseraggodes diringeri",
    "Aseraggodes dubius",
    "Aseraggodes filiger",
    "Aseraggodes firmisquamis",
    "Aseraggodes guttulatus",
    "Aseraggodes haackeanus",
    "Aseraggodes heemstrai",
    "Aseraggodes heraldi",
    "Aseraggodes herrei",
    "Aseraggodes holcomi",
    "Aseraggodes jenny",
    "Aseraggodes kaianus",
    "Aseraggodes kimurai",
    "Aseraggodes kobensis",
    "Aseraggodes lateralis",
    "Aseraggodes lenisquamis",
    "Aseraggodes longipinnis",
    "Aseraggodes magnoculus",
    "Aseraggodes matsuurai",
    "Aseraggodes melanostictus",
    "Aseraggodes microlepidotus",
    "Aseraggodes nigrocirratus",
    "Aseraggodes normani",
    "Aseraggodes orientalis",
    "Aseraggodes pelvicus",
    "Aseraggodes ramsaii",
    "Aseraggodes satapoomini",
    "Aseraggodes senoui",
    "Aseraggodes sinusarabici",
    "Aseraggodes steinitzi",
    "Aseraggodes suzumotoi",
    "Aseraggodes texturatus",
    "Aseraggodes therese",
    "Aseraggodes umbratilis",
    "Aseraggodes whitakeri",
    "Aseraggodes winterbottomi",
    "Aseraggodes xenicus",
    "Aseraggodes zizette",
    "Austroglossus microlepis",
    "Austroglossus pectoralis",
    "Barnardichthys fulvomarginata",
    "Bathysolea lactea",
    "Bathysolea lagarderae",
    "Bathysolea polli",
    "Bathysolea profundicola",
    "Brachirus aenea",
    "Brachirus annularis",
    "Brachirus aspilos",
    "Brachirus dicholepis",
    "Brachirus elongatus",
    "Brachirus harmandi",
    "Brachirus heterolepis",
    "Brachirus macrolepis",
    "Brachirus muelleri",
    "Brachirus niger",
    "Brachirus orientalis",
    "Brachirus pan",
    "Brachirus panoides",
    "Brachirus selheimi",
    "Brachirus siamensis",
    "Brachirus sorsogonensis",
    "Brachirus swinhonis",
    "Brachirus villosus",
    "Buglossidium luteum",
    "Dagetichthys lakdoensis",
    "Dicologlossa cuneata",
    "Dicologlossa hexophthalma",
    "Heteromycteris capensis",
    "Heteromycteris hartzfeldii",
    "Heteromycteris japonicus",
    "Heteromycteris matsubarai",
    "Heteromycteris oculus",
    "Heteromycteris proboscideus",
    "Leptachirus alleni",
    "Leptachirus bensbach",
    "Leptachirus darwinensis",
    "Leptachirus kikori",
    "Leptachirus klunzingeri",
    "Leptachirus lorentz",
    "Leptachirus polylepis",
    "Leptachirus robertsi",
    "Leptachirus triramus",
    "Liachirus melanospilos",
    "Liachirus whitleyi",
    "Microchirus azevia",
    "Microchirus boscanion",
    "Microchirus frechkopi",
    "Microchirus ocellatus",
    "Microchirus theophila",
    "Microchirus variegatus",
    "Microchirus wittei",
    "Monochirus hispidus",
    "Monochirus trichodactylus",
    "Paradicula setifer",
    "Pardachirus balius",
    "Pardachirus hedleyi",
    "Pardachirus marmoratus",
    "Pardachirus morrowi",
    "Pardachirus pavoninus",
    "Pardachirus poropterus",
    "Pegusa cadenati",
    "Pegusa impar",
    "Pegusa lascaris",
    "Pegusa nasuta",
    "Pegusa triophthalma",
    "Phyllichthys punctatus",
    "Phyllichthys sclerolepis",
    "Phyllichthys sejunctus",
    "Pseudaesopia japonica",
    "Rendahlia jaubertensis",
    "Rhinosolea microlepidota",
    "Solea aegyptiaca",
    "Solea capensis",
    "Solea elongata",
    "Solea heinii",
    "Solea ovata",
    "Solea senegalensis",
    "Solea solea",
    "Solea stanalandi",
    "Solea turbynei",
    "Soleichthys dori",
    "Soleichthys heterorhinos",
    "Soleichthys maculosus",
    "Soleichthys microcephalus",
    "Soleichthys oculofasciatus",
    "Soleichthys serpenpellis",
    "Soleichthys siammakuti",
    "Soleichthys tubiferus",
    "Synaptura albomaculata",
    "Synaptura cadenati",
    "Synaptura commersonnii",
    "Synaptura lusitanica lusitanica",
    "Synaptura lusitanica nigromaculata",
    "Synaptura marginata",
    "Synaptura megalepidoura",
    "Synaptura salinarum",
    "Synapturichthys kleinii",
    "Synclidopus hogani",
    "Synclidopus macleayanus",
    "Typhlachirus caecus",
    "Vanstraelenia chirophthalma",
    "Zebrias altipinnis",
    "Zebrias annandalei",
    "Zebrias cancellatus",
    "Zebrias captivus",
    "Zebrias craticula",
    "Zebrias crossolepis",
    "Zebrias fasciatus",
    "Zebrias keralensis",
    "Zebrias lucapensis",
    "Zebrias maculosus",
    "Zebrias munroi",
    "Zebrias penescalaris",
    "Zebrias quagga",
    "Zebrias regani",
    "Zebrias scalaris",
    "Zebrias synapturoides",
    "Zebrias zebra",
    "Zebrias zebrinus"
  ],
  "sampled_species": [
    "Aseraggodes heemstrai",
    "Aseraggodes kobensis",
    "Austroglossus microlepis",
    "Austroglossus pectoralis",
    "Bathysolea profundicola",
    "Buglossidium luteum",
    "Dicologlossa cuneata",
    "Dicologlossa hexophthalma",
    "Heteromycteris japonicus",
    "Microchirus azevia",
    "Microchirus boscanion",
    "Microchirus ocellatus",
    "Microchirus variegatus",
    "Monochirus hispidus",
    "Pardachirus marmoratus",
    "Pardachirus morrowi",
    "Pegusa cadenati",
    "Pegusa impar",
    "Pegusa lascaris",
    "Pegusa nasuta",
    "Pseudaesopia japonica",
    "Solea aegyptiaca",
    "Solea ovata",
    "Solea senegalensis",
    "Solea solea",
    "Soleichthys heterorhinos",
    "Synaptura lusitanica lusitanica",
    "Synapturichthys kleinii",
    "Zebrias fasciatus",
    "Zebrias zebra"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Achiroides leucorhynchos",
    "Achiroides melanorhynchus",
    "Aesopia cornuta",
    "Aseraggodes albidus",
    "Aseraggodes auroculus",
    "Aseraggodes bahamondei",
    "Aseraggodes beauforti",
    "Aseraggodes borehami",
    "Aseraggodes brevirostris",
    "Aseraggodes chapleaui",
    "Aseraggodes cheni",
    "Aseraggodes corymbus",
    "Aseraggodes crypticus",
    "Aseraggodes cyaneus",
    "Aseraggodes cyclurus",
    "Aseraggodes diringeri",
    "Aseraggodes dubius",
    "Aseraggodes filiger",
    "Aseraggodes firmisquamis",
    "Aseraggodes guttulatus",
    "Aseraggodes haackeanus",
    "Aseraggodes heraldi",
    "Aseraggodes herrei",
    "Aseraggodes holcomi",
    "Aseraggodes jenny",
    "Aseraggodes kaianus",
    "Aseraggodes kimurai",
    "Aseraggodes lateralis",
    "Aseraggodes lenisquamis",
    "Aseraggodes longipinnis",
    "Aseraggodes magnoculus",
    "Aseraggodes matsuurai",
    "Aseraggodes melanostictus",
    "Aseraggodes microlepidotus",
    "Aseraggodes nigrocirratus",
    "Aseraggodes normani",
    "Aseraggodes orientalis",
    "Aseraggodes pelvicus",
    "Aseraggodes ramsaii",
    "Aseraggodes satapoomini",
    "Aseraggodes senoui",
    "Aseraggodes sinusarabici",
    "Aseraggodes steinitzi",
    "Aseraggodes suzumotoi",
    "Aseraggodes texturatus",
    "Aseraggodes therese",
    "Aseraggodes umbratilis",
    "Aseraggodes whitakeri",
    "Aseraggodes winterbottomi",
    "Aseraggodes xenicus",
    "Aseraggodes zizette",
    "Barnardichthys fulvomarginata",
    "Bathysolea lactea",
    "Bathysolea lagarderae",
    "Bathysolea polli",
    "Brachirus aenea",
    "Brachirus annularis",
    "Brachirus aspilos",
    "Brachirus dicholepis",
    "Brachirus elongatus",
    "Brachirus harmandi",
    "Brachirus heterolepis",
    "Brachirus macrolepis",
    "Brachirus muelleri",
    "Brachirus niger",
    "Brachirus orientalis",
    "Brachirus pan",
    "Brachirus panoides",
    "Brachirus selheimi",
    "Brachirus siamensis",
    "Brachirus sorsogonensis",
    "Brachirus swinhonis",
    "Brachirus villosus",
    "Dagetichthys lakdoensis",
    "Heteromycteris capensis",
    "Heteromycteris hartzfeldii",
    "Heteromycteris matsubarai",
    "Heteromycteris oculus",
    "Heteromycteris proboscideus",
    "Leptachirus alleni",
    "Leptachirus bensbach",
    "Leptachirus darwinensis",
    "Leptachirus kikori",
    "Leptachirus klunzingeri",
    "Leptachirus lorentz",
    "Leptachirus polylepis",
    "Leptachirus robertsi",
    "Leptachirus triramus",
    "Liachirus melanospilos",
    "Liachirus whitleyi",
    "Microchirus frechkopi",
    "Microchirus theophila",
    "Microchirus wittei",
    "Monochirus trichodactylus",
    "Paradicula setifer",
    "Pardachirus balius",
    "Pardachirus hedleyi",
    "Pardachirus pavoninus",
    "Pardachirus poropterus",
    "Pegusa triophthalma",
    "Phyllichthys punctatus",
    "Phyllichthys sclerolepis",
    "Phyllichthys sejunctus",
    "Rendahlia jaubertensis",
    "Rhinosolea microlepidota",
    "Solea capensis",
    "Solea elongata",
    "Solea heinii",
    "Solea stanalandi",
    "Solea turbynei",
    "Soleichthys dori",
    "Soleichthys maculosus",
    "Soleichthys microcephalus",
    "Soleichthys oculofasciatus",
    "Soleichthys serpenpellis",
    "Soleichthys siammakuti",
    "Soleichthys tubiferus",
    "Synaptura albomaculata",
    "Synaptura cadenati",
    "Synaptura commersonnii",
    "Synaptura lusitanica nigromaculata",
    "Synaptura marginata",
    "Synaptura megalepidoura",
    "Synaptura salinarum",
    "Synclidopus hogani",
    "Synclidopus macleayanus",
    "Typhlachirus caecus",
    "Vanstraelenia chirophthalma",
    "Zebrias altipinnis",
    "Zebrias annandalei",
    "Zebrias cancellatus",
    "Zebrias captivus",
    "Zebrias craticula",
    "Zebrias crossolepis",
    "Zebrias keralensis",
    "Zebrias lucapensis",
    "Zebrias maculosus",
    "Zebrias munroi",
    "Zebrias penescalaris",
    "Zebrias quagga",
    "Zebrias regani",
    "Zebrias scalaris",
    "Zebrias synapturoides",
    "Zebrias zebrinus"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [
      "Aseraggodes kobensis",
      "Austroglossus microlepis",
      "Austroglossus pectoralis",
      "Dicologlossa cuneata",
      "Dicologlossa hexophthalma",
      "Microchirus azevia",
      "Microchirus boscanion",
      "Microchirus ocellatus",
      "Microchirus variegatus",
      "Monochirus hispidus",
      "Pegusa lascaris",
      "Pseudaesopia japonica",
      "Solea senegalensis",
      "Solea solea",
      "Synaptura lusitanica lusitanica",
      "Synapturichthys kleinii"
    ],
    "16s": [
      "Aseraggodes kobensis",
      "Austroglossus microlepis",
      "Austroglossus pectoralis",
      "Bathysolea profundicola",
      "Buglossidium luteum",
      "Dicologlossa cuneata",
      "Dicologlossa hexophthalma",
      "Heteromycteris japonicus",
      "Microchirus azevia",
      "Microchirus boscanion",
      "Microchirus ocellatus",
      "Microchirus variegatus",
      "Monochirus hispidus",
      "Pegusa impar",
      "Pegusa lascaris",
      "Pseudaesopia japonica",
      "Solea senegalensis",
      "Solea solea",
      "Synaptura lusitanica lusitanica",
      "Synapturichthys kleinii",
      "Zebrias zebra"
    ],
    "4c4": [],
    "coi": [
      "Austroglossus microlepis",
      "Austroglossus pectoralis",
      "Bathysolea profundicola",
      "Buglossidium luteum",
      "Dicologlossa cuneata",
      "Dicologlossa hexophthalma",
      "Heteromycteris japonicus",
      "Microchirus azevia",
      "Microchirus boscanion",
      "Microchirus variegatus",
      "Pardachirus marmoratus",
      "Pardachirus morrowi",
      "Pegusa impar",
      "Pegusa lascaris",
      "Pegusa nasuta",
      "Solea aegyptiaca",
      "Solea ovata",
      "Solea senegalensis",
      "Solea solea",
      "Synaptura lusitanica lusitanica",
      "Synapturichthys kleinii",
      "Zebrias fasciatus",
      "Zebrias zebra"
    ],
    "cytb": [
      "Austroglossus pectoralis",
      "Bathysolea profundicola",
      "Buglossidium luteum",
      "Dicologlossa cuneata",
      "Dicologlossa hexophthalma",
      "Microchirus azevia",
      "Microchirus boscanion",
      "Microchirus ocellatus",
      "Microchirus variegatus",
      "Monochirus hispidus",
      "Pegusa cadenati",
      "Pegusa impar",
      "Pegusa lascaris",
      "Solea aegyptiaca",
      "Solea senegalensis",
      "Solea solea",
      "Synaptura lusitanica lusitanica",
      "Synapturichthys kleinii"
    ],
    "enc1": [],
    "ficd": [],
    "glyt": [
      "Heteromycteris japonicus"
    ],
    "hoxc6a": [],
    "kiaa1239": [
      "Aseraggodes heemstrai",
      "Aseraggodes kobensis",
      "Heteromycteris japonicus"
    ],
    "myh6": [
      "Heteromycteris japonicus",
      "Soleichthys heterorhinos"
    ],
    "nd2": [],
    "nd4": [],
    "panx2": [
      "Heteromycteris japonicus",
      "Pseudaesopia japonica",
      "Solea solea",
      "Soleichthys heterorhinos"
    ],
    "plagl2": [
      "Heteromycteris japonicus",
      "Pseudaesopia japonica"
    ],
    "ptr": [
      "Aseraggodes kobensis",
      "Heteromycteris japonicus"
    ],
    "rag1": [
      "Heteromycteris japonicus",
      "Pegusa lascaris",
      "Solea solea"
    ],
    "rag2": [],
    "rhodopsin": [
      "Buglossidium luteum",
      "Dicologlossa cuneata",
      "Microchirus azevia",
      "Microchirus variegatus",
      "Pegusa cadenati",
      "Pegusa lascaris",
      "Solea aegyptiaca",
      "Solea senegalensis",
      "Solea solea",
      "Synaptura lusitanica lusitanica",
      "Synapturichthys kleinii"
    ],
    "ripk4": [],
    "sh3px3": [
      "Aseraggodes heemstrai",
      "Heteromycteris japonicus"
    ],
    "sidkey": [],
    "sreb2": [],
    "svep1": [
      "Soleichthys heterorhinos"
    ],
    "tbr1": [],
    "vcpip": [],
    "zic1": [
      "Aseraggodes kobensis",
      "Heteromycteris japonicus",
      "Pseudaesopia japonica"
    ]
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Euteleosteomorpha"
    ],
    "division": [
      "Euacanthomorphacea"
    ],
    "family": [
      "Soleidae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [
      "Eurypterygia"
    ],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Pleuronectiformes"
    ],
    "section": [
      "Ctenosquamata"
    ],
    "series": [
      "Carangaria"
    ],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Neoteleostei"
    ],
    "subdivision": [
      "Percomorphaceae"
    ],
    "suborder": [
      "Pleuronectoidei"
    ],
    "subsection": [
      "Acanthomorphata"
    ],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Aseraggodes heemstrai": 0.0796,
    "Aseraggodes kobensis": 0.0787,
    "Austroglossus microlepis": 0.0638,
    "Austroglossus pectoralis": 0.0638,
    "Bathysolea profundicola": 0.1333,
    "Buglossidium luteum": 0.0527,
    "Dicologlossa cuneata": 0.0701,
    "Dicologlossa hexophthalma": 0.0899,
    "Heteromycteris japonicus": 0.0725,
    "Microchirus azevia": 0.0823,
    "Microchirus boscanion": 0.0973,
    "Microchirus ocellatus": 0.1183,
    "Microchirus variegatus": 0.1384,
    "Monochirus hispidus": 0.1619,
    "Pardachirus marmoratus": 0.0803,
    "Pardachirus morrowi": 0.0823,
    "Pegusa cadenati": 0.0863,
    "Pegusa impar": 0.125,
    "Pegusa lascaris": 0.0835,
    "Pegusa nasuta": 0.0766,
    "Pseudaesopia japonica": 0.0721,
    "Solea aegyptiaca": 0.117,
    "Solea ovata": 0.0838,
    "Solea senegalensis": 0.1128,
    "Solea solea": 0.0881,
    "Soleichthys heterorhinos": 0.141,
    "Synaptura lusitanica lusitanica": 0.0635,
    "Synapturichthys kleinii": 0.1224,
    "Zebrias fasciatus": 0.1656,
    "Zebrias zebra": 0.1611
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Aseraggodes heemstrai": 0.0922,
    "Aseraggodes kobensis": 0.0922,
    "Austroglossus microlepis": 0.0922,
    "Austroglossus pectoralis": 0.0922,
    "Bathysolea profundicola": 0.0922,
    "Buglossidium luteum": 0.0922,
    "Dicologlossa cuneata": 0.0922,
    "Dicologlossa hexophthalma": 0.0922,
    "Heteromycteris japonicus": 0.0922,
    "Microchirus azevia": 0.0922,
    "Microchirus boscanion": 0.0922,
    "Microchirus ocellatus": 0.0922,
    "Microchirus variegatus": 0.0922,
    "Monochirus hispidus": 0.0922,
    "Pardachirus marmoratus": 0.0922,
    "Pardachirus morrowi": 0.0922,
    "Pegusa cadenati": 0.0923,
    "Pegusa impar": 0.0923,
    "Pegusa lascaris": 0.0923,
    "Pegusa nasuta": 0.0923,
    "Pseudaesopia japonica": 0.0922,
    "Solea aegyptiaca": 0.0923,
    "Solea ovata": 0.0923,
    "Solea senegalensis": 0.0923,
    "Solea solea": 0.0923,
    "Soleichthys heterorhinos": 0.0922,
    "Synaptura lusitanica lusitanica": 0.0922,
    "Synapturichthys kleinii": 0.0923,
    "Zebrias fasciatus": 0.0922,
    "Zebrias zebra": 0.0922
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Aseraggodes heemstrai": 0.0117,
    "Aseraggodes kobensis": 0.0117,
    "Austroglossus microlepis": 0.0117,
    "Austroglossus pectoralis": 0.0117,
    "Bathysolea profundicola": 0.0117,
    "Buglossidium luteum": 0.0117,
    "Dicologlossa cuneata": 0.0117,
    "Dicologlossa hexophthalma": 0.0117,
    "Heteromycteris japonicus": 0.0117,
    "Microchirus azevia": 0.0117,
    "Microchirus boscanion": 0.0117,
    "Microchirus ocellatus": 0.0117,
    "Microchirus variegatus": 0.0117,
    "Monochirus hispidus": 0.0117,
    "Pardachirus marmoratus": 0.0117,
    "Pardachirus morrowi": 0.0117,
    "Pegusa cadenati": 0.0117,
    "Pegusa impar": 0.0117,
    "Pegusa lascaris": 0.0117,
    "Pegusa nasuta": 0.0117,
    "Pseudaesopia japonica": 0.0117,
    "Solea aegyptiaca": 0.0117,
    "Solea ovata": 0.0117,
    "Solea senegalensis": 0.0117,
    "Solea solea": 0.0117,
    "Soleichthys heterorhinos": 0.0117,
    "Synaptura lusitanica lusitanica": 0.0117,
    "Synapturichthys kleinii": 0.0117,
    "Zebrias fasciatus": 0.0117,
    "Zebrias zebra": 0.0117
  },
  "mean_dr": 0.0988,
  "mean_bamm_lambda": 0.0922,
  "mean_bamm_mu": 0.0117,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/family/Soleidae.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/family/Soleidae.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/family/Soleidae.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/family/Soleidae_phylogram.tre",
  "rogues": [
    "Cynoglossus_robustus",
    "Cynoglossus_attenuatus",
    "Cynoglossus_oligolepis",
    "Cynoglossus_itinus",
    "Cynoglossus_interruptus",
    "Cynoglossus_kopsii",
    "Cynoglossus_marleyi",
    "Cynoglossus_lingua",
    "Cynoglossus_macrostomus",
    "Cynoglossus_puncticeps",
    "Cynoglossus_lida",
    "Cynoglossus_bilineatus",
    "Cynoglossus_joyneri",
    "Cynoglossus_lighti",
    "Cynoglossus_cynoglossus",
    "Cynoglossus_sinicus",
    "Cynoglossus_browni",
    "Cynoglossus_senegalensis",
    "Paraplagusia_japonica"
  ],
  "chronogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Soleidae_mrca.tre",
  "phylogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Soleidae_mrca_phylogram.tre"
}