{
  "species": [
    "Acanthocybium solandri",
    "Allothunnus fallai",
    "Auxis rochei eudorax",
    "Auxis rochei rochei",
    "Auxis thazard brachydorax",
    "Auxis thazard thazard",
    "Cybiosarda elegans",
    "Euthynnus affinis",
    "Euthynnus alletteratus",
    "Euthynnus lineatus",
    "Gasterochisma melampus",
    "Grammatorcynus bicarinatus",
    "Grammatorcynus bilineatus",
    "Gymnosarda unicolor",
    "Katsuwonus pelamis",
    "Orcynopsis unicolor",
    "Rastrelliger brachysoma",
    "Rastrelliger faughni",
    "Rastrelliger kanagurta",
    "Sarda australis",
    "Sarda chiliensis chiliensis",
    "Sarda chiliensis lineolata",
    "Sarda orientalis",
    "Sarda sarda",
    "Scomber australasicus",
    "Scomber colias",
    "Scomber japonicus",
    "Scomber scombrus",
    "Scomberomorus brasiliensis",
    "Scomberomorus cavalla",
    "Scomberomorus commerson",
    "Scomberomorus concolor",
    "Scomberomorus guttatus",
    "Scomberomorus koreanus",
    "Scomberomorus lineolatus",
    "Scomberomorus maculatus",
    "Scomberomorus multiradiatus",
    "Scomberomorus munroi",
    "Scomberomorus niphonius",
    "Scomberomorus plurilineatus",
    "Scomberomorus queenslandicus",
    "Scomberomorus regalis",
    "Scomberomorus semifasciatus",
    "Scomberomorus sierra",
    "Scomberomorus sinensis",
    "Scomberomorus tritor",
    "Thunnus alalunga",
    "Thunnus albacares",
    "Thunnus atlanticus",
    "Thunnus maccoyii",
    "Thunnus obesus",
    "Thunnus orientalis",
    "Thunnus thynnus",
    "Thunnus tonggol"
  ],
  "sampled_species": [
    "Acanthocybium solandri",
    "Allothunnus fallai",
    "Auxis rochei rochei",
    "Auxis thazard thazard",
    "Cybiosarda elegans",
    "Euthynnus affinis",
    "Euthynnus alletteratus",
    "Euthynnus lineatus",
    "Gasterochisma melampus",
    "Grammatorcynus bicarinatus",
    "Grammatorcynus bilineatus",
    "Gymnosarda unicolor",
    "Katsuwonus pelamis",
    "Rastrelliger brachysoma",
    "Rastrelliger faughni",
    "Rastrelliger kanagurta",
    "Sarda australis",
    "Sarda chiliensis chiliensis",
    "Sarda orientalis",
    "Sarda sarda",
    "Scomber australasicus",
    "Scomber colias",
    "Scomber japonicus",
    "Scomber scombrus",
    "Scomberomorus brasiliensis",
    "Scomberomorus cavalla",
    "Scomberomorus commerson",
    "Scomberomorus concolor",
    "Scomberomorus guttatus",
    "Scomberomorus koreanus",
    "Scomberomorus maculatus",
    "Scomberomorus munroi",
    "Scomberomorus niphonius",
    "Scomberomorus plurilineatus",
    "Scomberomorus queenslandicus",
    "Scomberomorus regalis",
    "Scomberomorus sierra",
    "Scomberomorus sinensis",
    "Scomberomorus tritor",
    "Thunnus alalunga",
    "Thunnus albacares",
    "Thunnus atlanticus",
    "Thunnus maccoyii",
    "Thunnus obesus",
    "Thunnus orientalis",
    "Thunnus thynnus",
    "Thunnus tonggol"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Auxis rochei eudorax",
    "Auxis thazard brachydorax",
    "Orcynopsis unicolor",
    "Sarda chiliensis lineolata",
    "Scomberomorus lineolatus",
    "Scomberomorus multiradiatus",
    "Scomberomorus semifasciatus"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber australasicus",
      "Scomber colias",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus commerson",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Scomberomorus tritor",
      "Thunnus alalunga",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus thynnus"
    ],
    "16s": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Allothunnus fallai",
      "Auxis thazard thazard",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda chiliensis chiliensis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber australasicus",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus commerson",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Scomberomorus sierra",
      "Scomberomorus tritor",
      "Thunnus alalunga",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus orientalis",
      "Thunnus tonggol"
    ],
    "4c4": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Allothunnus fallai",
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Cybiosarda elegans",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Grammatorcynus bicarinatus",
      "Grammatorcynus bilineatus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Rastrelliger kanagurta",
      "Sarda australis",
      "Sarda chiliensis chiliensis",
      "Sarda orientalis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber australasicus",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus commerson",
      "Scomberomorus koreanus",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus sierra",
      "Thunnus alalunga",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus tonggol"
    ],
    "coi": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Allothunnus fallai",
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Cybiosarda elegans",
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Euthynnus lineatus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Grammatorcynus bicarinatus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Rastrelliger brachysoma",
      "Rastrelliger faughni",
      "Rastrelliger kanagurta",
      "Sarda australis",
      "Sarda chiliensis chiliensis",
      "Sarda orientalis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber australasicus",
      "Scomber colias",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus brasiliensis",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus commerson",
      "Scomberomorus guttatus",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus munroi",
      "Scomberomorus niphonius",
      "Scomberomorus plurilineatus",
      "Scomberomorus queenslandicus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Scomberomorus sierra",
      "Thunnus alalunga",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus",
      "Thunnus maccoyii",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus orientalis",
      "Thunnus thynnus",
      "Thunnus tonggol"
    ],
    "cytb": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Allothunnus fallai",
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Cybiosarda elegans",
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Euthynnus lineatus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Grammatorcynus bicarinatus",
      "Grammatorcynus bilineatus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Rastrelliger brachysoma",
      "Rastrelliger faughni",
      "Rastrelliger kanagurta",
      "Sarda chiliensis chiliensis",
      "Sarda orientalis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber australasicus",
      "Scomber colias",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus brasiliensis",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus commerson",
      "Scomberomorus guttatus",
      "Scomberomorus koreanus",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus munroi",
      "Scomberomorus niphonius",
      "Scomberomorus queenslandicus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Scomberomorus sierra",
      "Scomberomorus sinensis",
      "Scomberomorus tritor",
      "Thunnus alalunga",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus",
      "Thunnus maccoyii",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus orientalis",
      "Thunnus thynnus",
      "Thunnus tonggol"
    ],
    "enc1": [
      "Euthynnus alletteratus",
      "Sarda sarda"
    ],
    "ficd": [
      "Auxis rochei rochei",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus"
    ],
    "glyt": [
      "Sarda sarda"
    ],
    "hoxc6a": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Euthynnus affinis",
      "Gymnosarda unicolor"
    ],
    "kiaa1239": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Euthynnus affinis",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "myh6": [
      "Sarda sarda",
      "Scomber scombrus"
    ],
    "nd2": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Rastrelliger kanagurta",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus brasiliensis",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus concolor",
      "Scomberomorus guttatus",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Scomberomorus sierra",
      "Scomberomorus tritor",
      "Thunnus thynnus"
    ],
    "nd4": [
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Scomberomorus brasiliensis",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus tonggol"
    ],
    "panx2": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Euthynnus affinis",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Scomber scombrus",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "plagl2": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "ptr": [
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus regalis"
    ],
    "rag1": [
      "Rastrelliger brachysoma",
      "Sarda sarda",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus commerson"
    ],
    "rag2": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis thazard thazard",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus"
    ],
    "rhodopsin": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Auxis thazard thazard",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gasterochisma melampus",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber colias",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus brasiliensis",
      "Scomberomorus cavalla",
      "Scomberomorus commerson",
      "Scomberomorus maculatus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus alalunga",
      "Thunnus albacares",
      "Thunnus atlanticus",
      "Thunnus obesus",
      "Thunnus orientalis",
      "Thunnus thynnus"
    ],
    "ripk4": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "sh3px3": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus"
    ],
    "sidkey": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus affinis",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "sreb2": [
      "Sarda sarda"
    ],
    "svep1": [
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "tbr1": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Scomber scombrus",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "vcpip": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus affinis",
      "Euthynnus alletteratus",
      "Sarda sarda",
      "Scomberomorus regalis",
      "Thunnus albacares"
    ],
    "zic1": [
      "Acanthocybium solandri",
      "Auxis rochei rochei",
      "Euthynnus affinis",
      "Gymnosarda unicolor",
      "Katsuwonus pelamis",
      "Sarda sarda",
      "Scomber japonicus",
      "Thunnus albacares"
    ]
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Euteleosteomorpha"
    ],
    "division": [
      "Euacanthomorphacea"
    ],
    "family": [
      "Scombridae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [
      "Eurypterygia"
    ],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Scombriformes"
    ],
    "section": [
      "Ctenosquamata"
    ],
    "series": [
      "Pelagiaria"
    ],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Neoteleostei"
    ],
    "subdivision": [
      "Percomorphaceae"
    ],
    "suborder": [],
    "subsection": [
      "Acanthomorphata"
    ],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Acanthocybium solandri": 0.0287,
    "Allothunnus fallai": 0.023,
    "Cybiosarda elegans": 0.0229,
    "Euthynnus affinis": 0.1405,
    "Euthynnus alletteratus": 0.0748,
    "Euthynnus lineatus": 0.1405,
    "Gasterochisma melampus": 0.0181,
    "Grammatorcynus bicarinatus": 0.0337,
    "Grammatorcynus bilineatus": 0.0337,
    "Gymnosarda unicolor": 0.0288,
    "Katsuwonus pelamis": 0.0701,
    "Rastrelliger brachysoma": 0.0857,
    "Rastrelliger faughni": 0.0857,
    "Rastrelliger kanagurta": 0.0504,
    "Sarda australis": 0.0774,
    "Sarda orientalis": 0.0733,
    "Sarda sarda": 0.0812,
    "Scomber australasicus": 0.1173,
    "Scomber colias": 0.0628,
    "Scomber japonicus": 0.1173,
    "Scomber scombrus": 0.0351,
    "Scomberomorus brasiliensis": 0.1374,
    "Scomberomorus cavalla": 0.0402,
    "Scomberomorus commerson": 0.0603,
    "Scomberomorus concolor": 0.1249,
    "Scomberomorus guttatus": 0.0935,
    "Scomberomorus koreanus": 0.073,
    "Scomberomorus maculatus": 0.2177,
    "Scomberomorus munroi": 0.068,
    "Scomberomorus niphonius": 0.0678,
    "Scomberomorus plurilineatus": 0.0946,
    "Scomberomorus queenslandicus": 0.0581,
    "Scomberomorus regalis": 0.2205,
    "Scomberomorus sierra": 0.1207,
    "Scomberomorus sinensis": 0.0458,
    "Scomberomorus tritor": 0.0599,
    "Thunnus alalunga": 0.2621,
    "Thunnus albacares": 0.2778,
    "Thunnus atlanticus": 0.0572,
    "Thunnus maccoyii": 0.3675,
    "Thunnus obesus": 0.2778,
    "Thunnus orientalis": 0.5268,
    "Thunnus thynnus": 0.5268,
    "Thunnus tonggol": 0.101,
    "Auxis rochei rochei": 0.1289,
    "Auxis thazard thazard": 0.1491,
    "Sarda chiliensis chiliensis": 0.0789
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Acanthocybium solandri": 0.055,
    "Allothunnus fallai": 0.055,
    "Cybiosarda elegans": 0.055,
    "Euthynnus affinis": 0.0555,
    "Euthynnus alletteratus": 0.0555,
    "Euthynnus lineatus": 0.0555,
    "Gasterochisma melampus": 0.055,
    "Grammatorcynus bicarinatus": 0.055,
    "Grammatorcynus bilineatus": 0.055,
    "Gymnosarda unicolor": 0.055,
    "Katsuwonus pelamis": 0.0555,
    "Rastrelliger brachysoma": 0.055,
    "Rastrelliger faughni": 0.055,
    "Rastrelliger kanagurta": 0.055,
    "Sarda australis": 0.0551,
    "Sarda orientalis": 0.0551,
    "Sarda sarda": 0.0551,
    "Scomber australasicus": 0.055,
    "Scomber colias": 0.055,
    "Scomber japonicus": 0.055,
    "Scomber scombrus": 0.055,
    "Scomberomorus brasiliensis": 0.0559,
    "Scomberomorus cavalla": 0.055,
    "Scomberomorus commerson": 0.055,
    "Scomberomorus concolor": 0.0559,
    "Scomberomorus guttatus": 0.055,
    "Scomberomorus koreanus": 0.055,
    "Scomberomorus maculatus": 0.0559,
    "Scomberomorus munroi": 0.055,
    "Scomberomorus niphonius": 0.055,
    "Scomberomorus plurilineatus": 0.055,
    "Scomberomorus queenslandicus": 0.055,
    "Scomberomorus regalis": 0.0559,
    "Scomberomorus sierra": 0.0559,
    "Scomberomorus sinensis": 0.055,
    "Scomberomorus tritor": 0.0554,
    "Thunnus alalunga": 0.4504,
    "Thunnus albacares": 0.4504,
    "Thunnus atlanticus": 0.1502,
    "Thunnus maccoyii": 0.4504,
    "Thunnus obesus": 0.4504,
    "Thunnus orientalis": 0.4504,
    "Thunnus thynnus": 0.4504,
    "Thunnus tonggol": 0.4288,
    "Auxis rochei rochei": 0.0555,
    "Auxis thazard thazard": 0.0555,
    "Sarda chiliensis chiliensis": 0.0551
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Acanthocybium solandri": 0.0003,
    "Allothunnus fallai": 0.0003,
    "Cybiosarda elegans": 0.0003,
    "Euthynnus affinis": 0.0008,
    "Euthynnus alletteratus": 0.0008,
    "Euthynnus lineatus": 0.0008,
    "Gasterochisma melampus": 0.0003,
    "Grammatorcynus bicarinatus": 0.0003,
    "Grammatorcynus bilineatus": 0.0003,
    "Gymnosarda unicolor": 0.0003,
    "Katsuwonus pelamis": 0.0008,
    "Rastrelliger brachysoma": 0.0003,
    "Rastrelliger faughni": 0.0003,
    "Rastrelliger kanagurta": 0.0003,
    "Sarda australis": 0.0003,
    "Sarda orientalis": 0.0003,
    "Sarda sarda": 0.0003,
    "Scomber australasicus": 0.0003,
    "Scomber colias": 0.0003,
    "Scomber japonicus": 0.0003,
    "Scomber scombrus": 0.0003,
    "Scomberomorus brasiliensis": 0.001,
    "Scomberomorus cavalla": 0.0003,
    "Scomberomorus commerson": 0.0003,
    "Scomberomorus concolor": 0.001,
    "Scomberomorus guttatus": 0.0003,
    "Scomberomorus koreanus": 0.0003,
    "Scomberomorus maculatus": 0.001,
    "Scomberomorus munroi": 0.0003,
    "Scomberomorus niphonius": 0.0003,
    "Scomberomorus plurilineatus": 0.0003,
    "Scomberomorus queenslandicus": 0.0003,
    "Scomberomorus regalis": 0.001,
    "Scomberomorus sierra": 0.001,
    "Scomberomorus sinensis": 0.0003,
    "Scomberomorus tritor": 0.0009,
    "Thunnus alalunga": 0.1652,
    "Thunnus albacares": 0.1652,
    "Thunnus atlanticus": 0.0505,
    "Thunnus maccoyii": 0.1652,
    "Thunnus obesus": 0.1652,
    "Thunnus orientalis": 0.1652,
    "Thunnus thynnus": 0.1652,
    "Thunnus tonggol": 0.1572,
    "Auxis rochei rochei": 0.0008,
    "Auxis thazard thazard": 0.0008,
    "Sarda chiliensis chiliensis": 0.0003
  },
  "mean_dr": 0.1199,
  "mean_bamm_lambda": 0.1156,
  "mean_bamm_mu": 0.0259,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/family/Scombridae.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/family/Scombridae.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/family/Scombridae.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/family/Scombridae_phylogram.tre",
  "rogues": []
}