{
  "species": [
    "Arctozenus risso",
    "Dolichosudis fuliginosa",
    "Lestidiops affinis",
    "Lestidiops bathyopteryx",
    "Lestidiops cadenati",
    "Lestidiops distans",
    "Lestidiops extrema",
    "Lestidiops gracilis",
    "Lestidiops indopacifica",
    "Lestidiops jayakari jayakari",
    "Lestidiops jayakari pseudosphyraenoides",
    "Lestidiops mirabilis",
    "Lestidiops neles",
    "Lestidiops pacificus",
    "Lestidiops ringens",
    "Lestidiops similis",
    "Lestidiops sphyraenopsis",
    "Lestidiops sphyrenoides",
    "Lestidium atlanticum",
    "Lestidium bigelowi",
    "Lestidium nudum",
    "Lestidium prolixum",
    "Lestrolepis intermedia",
    "Lestrolepis japonica",
    "Lestrolepis luetkeni",
    "Macroparalepis affinis",
    "Macroparalepis brevis",
    "Macroparalepis danae",
    "Macroparalepis johnfitchi",
    "Macroparalepis longilateralis",
    "Macroparalepis macrogeneion",
    "Macroparalepis nigra",
    "Magnisudis atlantica",
    "Magnisudis indica",
    "Magnisudis prionosa",
    "Notolepis annulata",
    "Notolepis coatsi",
    "Paralepis brevirostris",
    "Paralepis coregonoides",
    "Paralepis elongata",
    "Paralepis speciosa",
    "Stemonosudis bullisi",
    "Stemonosudis distans",
    "Stemonosudis elegans",
    "Stemonosudis elongata",
    "Stemonosudis gracilis",
    "Stemonosudis intermedia",
    "Stemonosudis macrura",
    "Stemonosudis miscella",
    "Stemonosudis molesta",
    "Stemonosudis rothschildi",
    "Stemonosudis siliquiventer",
    "Uncisudis advena",
    "Uncisudis longirostra",
    "Uncisudis posteropelvis",
    "Uncisudis quadrimaculata"
  ],
  "sampled_species": [
    "Lestidiops jayakari jayakari",
    "Lestidiops pacificus",
    "Lestidiops ringens",
    "Lestidium atlanticum",
    "Lestrolepis intermedia",
    "Macroparalepis johnfitchi",
    "Magnisudis atlantica",
    "Magnisudis prionosa",
    "Notolepis coatsi",
    "Stemonosudis intermedia",
    "Stemonosudis macrura"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Arctozenus risso",
    "Dolichosudis fuliginosa",
    "Lestidiops affinis",
    "Lestidiops bathyopteryx",
    "Lestidiops cadenati",
    "Lestidiops distans",
    "Lestidiops extrema",
    "Lestidiops gracilis",
    "Lestidiops indopacifica",
    "Lestidiops jayakari pseudosphyraenoides",
    "Lestidiops mirabilis",
    "Lestidiops neles",
    "Lestidiops similis",
    "Lestidiops sphyraenopsis",
    "Lestidiops sphyrenoides",
    "Lestidium bigelowi",
    "Lestidium nudum",
    "Lestidium prolixum",
    "Lestrolepis japonica",
    "Lestrolepis luetkeni",
    "Macroparalepis affinis",
    "Macroparalepis brevis",
    "Macroparalepis danae",
    "Macroparalepis longilateralis",
    "Macroparalepis macrogeneion",
    "Macroparalepis nigra",
    "Magnisudis indica",
    "Notolepis annulata",
    "Paralepis brevirostris",
    "Paralepis coregonoides",
    "Paralepis elongata",
    "Paralepis speciosa",
    "Stemonosudis bullisi",
    "Stemonosudis distans",
    "Stemonosudis elegans",
    "Stemonosudis elongata",
    "Stemonosudis gracilis",
    "Stemonosudis miscella",
    "Stemonosudis molesta",
    "Stemonosudis rothschildi",
    "Stemonosudis siliquiventer",
    "Uncisudis advena",
    "Uncisudis longirostra",
    "Uncisudis posteropelvis",
    "Uncisudis quadrimaculata"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [],
    "16s": [
      "Lestidiops pacificus",
      "Lestidiops ringens",
      "Macroparalepis johnfitchi",
      "Magnisudis atlantica",
      "Stemonosudis macrura"
    ],
    "4c4": [],
    "coi": [
      "Lestidiops ringens",
      "Macroparalepis johnfitchi",
      "Magnisudis atlantica",
      "Magnisudis prionosa",
      "Notolepis coatsi",
      "Stemonosudis macrura"
    ],
    "cytb": [],
    "enc1": [
      "Lestidiops jayakari jayakari",
      "Lestidium atlanticum",
      "Lestrolepis intermedia",
      "Macroparalepis johnfitchi",
      "Magnisudis atlantica",
      "Stemonosudis macrura"
    ],
    "ficd": [
      "Lestidiops jayakari jayakari",
      "Stemonosudis intermedia"
    ],
    "glyt": [],
    "hoxc6a": [
      "Lestidiops jayakari jayakari"
    ],
    "kiaa1239": [
      "Lestidiops jayakari jayakari"
    ],
    "myh6": [
      "Lestidiops jayakari jayakari",
      "Stemonosudis intermedia"
    ],
    "nd2": [],
    "nd4": [],
    "panx2": [],
    "plagl2": [
      "Lestidiops jayakari jayakari",
      "Lestidiops ringens",
      "Lestidium atlanticum",
      "Lestrolepis intermedia",
      "Macroparalepis johnfitchi",
      "Magnisudis atlantica",
      "Stemonosudis macrura"
    ],
    "ptr": [],
    "rag1": [
      "Lestidiops jayakari jayakari",
      "Lestidium atlanticum",
      "Lestrolepis intermedia",
      "Macroparalepis johnfitchi",
      "Stemonosudis macrura"
    ],
    "rag2": [],
    "rhodopsin": [
      "Notolepis coatsi"
    ],
    "ripk4": [
      "Lestidiops jayakari jayakari"
    ],
    "sh3px3": [
      "Stemonosudis intermedia"
    ],
    "sidkey": [
      "Lestidiops jayakari jayakari",
      "Stemonosudis intermedia"
    ],
    "sreb2": [],
    "svep1": [],
    "tbr1": [],
    "vcpip": [],
    "zic1": [
      "Macroparalepis johnfitchi",
      "Magnisudis atlantica"
    ]
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Euteleosteomorpha"
    ],
    "division": [],
    "family": [
      "Paralepididae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [
      "Eurypterygia"
    ],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Aulopiformes"
    ],
    "section": [
      "Aulopa"
    ],
    "series": [],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Neoteleostei"
    ],
    "subdivision": [],
    "suborder": [
      "Alepisauroidei"
    ],
    "subsection": [],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Lestidiops pacificus": 0.0481,
    "Lestidiops ringens": 0.0925,
    "Lestidium atlanticum": 0.0631,
    "Lestrolepis intermedia": 0.0546,
    "Macroparalepis johnfitchi": 0.0471,
    "Magnisudis atlantica": 0.0668,
    "Magnisudis prionosa": 0.0661,
    "Notolepis coatsi": 0.0556,
    "Stemonosudis intermedia": 0.0502,
    "Stemonosudis macrura": 0.0916,
    "Lestidiops jayakari jayakari": 0.0619
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Lestidiops pacificus": 0.0348,
    "Lestidiops ringens": 0.0348,
    "Lestidium atlanticum": 0.0347,
    "Lestrolepis intermedia": 0.0347,
    "Macroparalepis johnfitchi": 0.0348,
    "Magnisudis atlantica": 0.0348,
    "Magnisudis prionosa": 0.0348,
    "Notolepis coatsi": 0.0348,
    "Stemonosudis intermedia": 0.0347,
    "Stemonosudis macrura": 0.0348,
    "Lestidiops jayakari jayakari": 0.0347
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Lestidiops pacificus": 0.001,
    "Lestidiops ringens": 0.001,
    "Lestidium atlanticum": 0.0011,
    "Lestrolepis intermedia": 0.0011,
    "Macroparalepis johnfitchi": 0.001,
    "Magnisudis atlantica": 0.001,
    "Magnisudis prionosa": 0.001,
    "Notolepis coatsi": 0.001,
    "Stemonosudis intermedia": 0.0011,
    "Stemonosudis macrura": 0.001,
    "Lestidiops jayakari jayakari": 0.0011
  },
  "mean_dr": 0.0634,
  "mean_bamm_lambda": 0.0348,
  "mean_bamm_mu": 0.0011,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/family/Paralepididae.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/family/Paralepididae.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/family/Paralepididae.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/family/Paralepididae_phylogram.tre",
  "rogues": [
    "Coccorella_atlantica",
    "Evermannella_indica",
    "Evermannella_balbo",
    "Anotopterus_nikparini",
    "Anotopterus_pharao",
    "Alepisaurus_ferox",
    "Alepisaurus_brevirostris",
    "Omosudis_lowii",
    "Sudis_atrox"
  ],
  "chronogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Paralepididae_mrca.tre",
  "phylogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Paralepididae_mrca_phylogram.tre"
}