{
  "species": [
    "Lyconodes argenteus",
    "Lyconus brachycolus",
    "Lyconus pinnatus",
    "Macruronus capensis",
    "Macruronus maderensis",
    "Macruronus magellanicus",
    "Macruronus novaezelandiae",
    "Merluccius albidus",
    "Merluccius angustimanus",
    "Merluccius australis",
    "Merluccius bilinearis",
    "Merluccius capensis",
    "Merluccius gayi gayi",
    "Merluccius gayi peruanus",
    "Merluccius hernandezi",
    "Merluccius hubbsi",
    "Merluccius merluccius",
    "Merluccius paradoxus",
    "Merluccius patagonicus",
    "Merluccius polli",
    "Merluccius productus",
    "Merluccius senegalensis",
    "Merluccius tasmanicus"
  ],
  "sampled_species": [
    "Lyconus brachycolus",
    "Lyconus pinnatus",
    "Macruronus magellanicus",
    "Macruronus novaezelandiae",
    "Merluccius albidus",
    "Merluccius angustimanus",
    "Merluccius australis",
    "Merluccius bilinearis",
    "Merluccius capensis",
    "Merluccius gayi gayi",
    "Merluccius hernandezi",
    "Merluccius hubbsi",
    "Merluccius merluccius",
    "Merluccius paradoxus",
    "Merluccius polli",
    "Merluccius productus",
    "Merluccius senegalensis"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Lyconodes argenteus",
    "Macruronus capensis",
    "Macruronus maderensis",
    "Merluccius gayi peruanus",
    "Merluccius patagonicus",
    "Merluccius tasmanicus"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [
      "Macruronus magellanicus",
      "Macruronus novaezelandiae",
      "Merluccius albidus",
      "Merluccius angustimanus",
      "Merluccius australis",
      "Merluccius bilinearis",
      "Merluccius capensis",
      "Merluccius gayi gayi",
      "Merluccius hubbsi",
      "Merluccius merluccius",
      "Merluccius paradoxus",
      "Merluccius polli",
      "Merluccius productus",
      "Merluccius senegalensis"
    ],
    "16s": [
      "Macruronus magellanicus",
      "Macruronus novaezelandiae",
      "Merluccius albidus",
      "Merluccius angustimanus",
      "Merluccius australis",
      "Merluccius bilinearis",
      "Merluccius capensis",
      "Merluccius gayi gayi",
      "Merluccius hubbsi",
      "Merluccius merluccius",
      "Merluccius paradoxus",
      "Merluccius polli",
      "Merluccius productus",
      "Merluccius senegalensis"
    ],
    "4c4": [],
    "coi": [
      "Lyconus brachycolus",
      "Macruronus magellanicus",
      "Macruronus novaezelandiae",
      "Merluccius albidus",
      "Merluccius angustimanus",
      "Merluccius australis",
      "Merluccius bilinearis",
      "Merluccius capensis",
      "Merluccius gayi gayi",
      "Merluccius hubbsi",
      "Merluccius merluccius",
      "Merluccius paradoxus",
      "Merluccius polli",
      "Merluccius productus",
      "Merluccius senegalensis"
    ],
    "cytb": [
      "Lyconus brachycolus",
      "Lyconus pinnatus",
      "Macruronus magellanicus",
      "Macruronus novaezelandiae",
      "Merluccius albidus",
      "Merluccius angustimanus",
      "Merluccius australis",
      "Merluccius bilinearis",
      "Merluccius capensis",
      "Merluccius gayi gayi",
      "Merluccius hernandezi",
      "Merluccius hubbsi",
      "Merluccius merluccius",
      "Merluccius paradoxus",
      "Merluccius polli",
      "Merluccius productus",
      "Merluccius senegalensis"
    ],
    "enc1": [],
    "ficd": [],
    "glyt": [],
    "hoxc6a": [
      "Merluccius bilinearis"
    ],
    "kiaa1239": [],
    "myh6": [],
    "nd2": [],
    "nd4": [],
    "panx2": [
      "Merluccius bilinearis",
      "Merluccius productus"
    ],
    "plagl2": [],
    "ptr": [],
    "rag1": [
      "Macruronus novaezelandiae",
      "Merluccius albidus",
      "Merluccius australis",
      "Merluccius bilinearis",
      "Merluccius capensis",
      "Merluccius gayi gayi",
      "Merluccius hubbsi",
      "Merluccius merluccius",
      "Merluccius polli",
      "Merluccius productus"
    ],
    "rag2": [],
    "rhodopsin": [
      "Macruronus novaezelandiae",
      "Merluccius australis",
      "Merluccius capensis",
      "Merluccius gayi gayi",
      "Merluccius hubbsi",
      "Merluccius merluccius",
      "Merluccius paradoxus",
      "Merluccius polli",
      "Merluccius productus",
      "Merluccius senegalensis"
    ],
    "ripk4": [],
    "sh3px3": [],
    "sidkey": [],
    "sreb2": [],
    "svep1": [],
    "tbr1": [],
    "vcpip": [],
    "zic1": []
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Euteleosteomorpha"
    ],
    "division": [
      "Paracanthomorphacea"
    ],
    "family": [
      "Merlucciidae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [
      "Eurypterygia"
    ],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Gadiformes"
    ],
    "section": [
      "Ctenosquamata"
    ],
    "series": [
      "Zeiogadaria"
    ],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Neoteleostei"
    ],
    "subdivision": [],
    "suborder": [
      "Gadoidei"
    ],
    "subsection": [
      "Acanthomorphata"
    ],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Lyconus brachycolus": 0.0739,
    "Lyconus pinnatus": 0.0739,
    "Macruronus magellanicus": 0.0496,
    "Macruronus novaezelandiae": 0.0557,
    "Merluccius albidus": 0.1703,
    "Merluccius angustimanus": 0.347,
    "Merluccius australis": 0.1175,
    "Merluccius bilinearis": 0.0495,
    "Merluccius capensis": 0.0659,
    "Merluccius gayi gayi": 0.2125,
    "Merluccius hernandezi": 0.3515,
    "Merluccius hubbsi": 0.18,
    "Merluccius merluccius": 0.1029,
    "Merluccius paradoxus": 0.0703,
    "Merluccius polli": 0.0747,
    "Merluccius productus": 0.1366,
    "Merluccius senegalensis": 0.1004
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Lyconus brachycolus": 0.0522,
    "Lyconus pinnatus": 0.0522,
    "Macruronus magellanicus": 0.0522,
    "Macruronus novaezelandiae": 0.0522,
    "Merluccius albidus": 0.1219,
    "Merluccius angustimanus": 0.1219,
    "Merluccius australis": 0.1219,
    "Merluccius bilinearis": 0.0784,
    "Merluccius capensis": 0.0632,
    "Merluccius gayi gayi": 0.1219,
    "Merluccius hernandezi": 0.1219,
    "Merluccius hubbsi": 0.1219,
    "Merluccius merluccius": 0.0632,
    "Merluccius paradoxus": 0.0632,
    "Merluccius polli": 0.0632,
    "Merluccius productus": 0.1219,
    "Merluccius senegalensis": 0.0632
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Lyconus brachycolus": 0.0003,
    "Lyconus pinnatus": 0.0003,
    "Macruronus magellanicus": 0.0003,
    "Macruronus novaezelandiae": 0.0003,
    "Merluccius albidus": 0.034,
    "Merluccius angustimanus": 0.034,
    "Merluccius australis": 0.034,
    "Merluccius bilinearis": 0.0145,
    "Merluccius capensis": 0.0067,
    "Merluccius gayi gayi": 0.034,
    "Merluccius hernandezi": 0.034,
    "Merluccius hubbsi": 0.034,
    "Merluccius merluccius": 0.0067,
    "Merluccius paradoxus": 0.0067,
    "Merluccius polli": 0.0067,
    "Merluccius productus": 0.034,
    "Merluccius senegalensis": 0.0067
  },
  "mean_dr": 0.1313,
  "mean_bamm_lambda": 0.0857,
  "mean_bamm_mu": 0.0169,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/family/Merlucciidae.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/family/Merlucciidae.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/family/Merlucciidae.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/family/Merlucciidae_phylogram.tre",
  "rogues": [
    "Coelorinchus_anatirostris",
    "Coelorinchus_productus",
    "Coelorinchus_macrochir",
    "Coelorinchus_smithi",
    "Coelorinchus_japonicus",
    "Coelorinchus_jordani",
    "Coelorinchus_kishinouyei",
    "Coelorinchus_braueri",
    "Coelorinchus_flabellispinnis",
    "Coelorinchus_acanthiger",
    "Coelorinchus_gilberti",
    "Coelorinchus_occa",
    "Coelorinchus_kermadecus",
    "Coelorinchus_kaiyomaru",
    "Coelorinchus_innotabilis",
    "Coelorinchus_oliverianus",
    "Coelorinchus_multispinulosus",
    "Coelorinchus_formosanus",
    "Coelorinchus_kamoharai",
    "Coelorinchus_denticulatus",
    "Coelorinchus_longissimus",
    "Coelorinchus_hubbsi",
    "Coelorinchus_matamua",
    "Coelorinchus_aspercephalus",
    "Coelorinchus_biclinozonalis",
    "Coelorinchus_bollonsi",
    "Coelorinchus_simorhynchus",
    "Coelorinchus_fasciatus",
    "Coelorinchus_parvifasciatus",
    "Macrourus_holotrachys",
    "Macrourus_berglax",
    "Macrourus_whitsoni",
    "Macrourus_carinatus",
    "Coelorinchus_caelorhincus",
    "Coelorinchus_marinii",
    "Coelorinchus_geronimo",
    "Coelorinchus_polli",
    "Coelorinchus_scaphopsis",
    "Coelorinchus_caribbaeus",
    "Albatrossia_pectoralis",
    "Coryphaenoides_acrolepis",
    "Coryphaenoides_longifilis",
    "Coryphaenoides_filifer",
    "Coryphaenoides_cinereus",
    "Cynomacrurus_piriei",
    "Coryphaenoides_subserrulatus",
    "Coryphaenoides_serrulatus",
    "Coryphaenoides_marshalli",
    "Coryphaenoides_paramarshalli",
    "Coryphaenoides_guentheri",
    "Coryphaenoides_zaniophorus",
    "Coryphaenoides_alateralis",
    "Coryphaenoides_rupestris",
    "Coryphaenoides_nasutus",
    "Coryphaenoides_marginatus",
    "Coryphaenoides_yaquinae",
    "Coryphaenoides_ferrieri",
    "Coryphaenoides_armatus",
    "Coryphaenoides_lecointei",
    "Coryphaenoides_profundicolus",
    "Coryphaenoides_leptolepis",
    "Coryphaenoides_mediterraneus",
    "Coryphaenoides_carapinus",
    "Coryphaenoides_dossenus",
    "Nezumia_milleri",
    "Nezumia_aequalis",
    "Nezumia_longebarbata",
    "Nezumia_liolepis",
    "Nezumia_micronychodon",
    "Nezumia_duodecim",
    "Nezumia_bairdii",
    "Mesobius_antipodum",
    "Trachonurus_sulcatus",
    "Malacocephalus_occidentalis",
    "Malacocephalus_laevis",
    "Odontomacrurus_murrayi",
    "Ventrifossa_johnboborum",
    "Ventrifossa_garmani",
    "Ventrifossa_longibarbata",
    "Ventrifossa_rhipidodorsalis",
    "Sphagemacrurus_hirundo",
    "Paracetonurus_flagellicauda",
    "Nezumia_proxima",
    "Nezumia_sclerorhynchus",
    "Hymenocephalus_longiceps",
    "Hymenocephalus_striatissimus_striatissimus",
    "Hymenocephalus_italicus",
    "Lucigadus_nigromaculatus",
    "Bathygadus_macrops",
    "Bathygadus_melanobranchus",
    "Bathygadus_antrodes",
    "Bathygadus_favosus",
    "Gadomus_colletti",
    "Gadomus_dispar",
    "Bregmaceros_atlanticus",
    "Bregmaceros_cantori",
    "Steindachneria_argentea",
    "Gadus_macrocephalus",
    "Gadus_ogac",
    "Theragra_chalcogramma",
    "Arctogadus_glacialis",
    "Arctogadus_borisovi",
    "Gadus_morhua",
    "Boreogadus_saida",
    "Merlangius_merlangus",
    "Melanogrammus_aeglefinus",
    "Pollachius_virens",
    "Pollachius_pollachius",
    "Eleginus_nawaga",
    "Eleginus_gracilis",
    "Microgadus_proximus",
    "Microgadus_tomcod",
    "Trisopterus_minutus",
    "Trisopterus_capelanus",
    "Trisopterus_esmarkii",
    "Trisopterus_luscus",
    "Micromesistius_poutassou",
    "Micromesistius_australis",
    "Gadiculus_argenteus",
    "Lota_lota",
    "Molva_dypterygia",
    "Molva_macrophthalma",
    "Molva_molva",
    "Brosme_brosme",
    "Gaidropsarus_argentatus",
    "Gaidropsarus_ensis",
    "Gaidropsarus_biscayensis",
    "Gaidropsarus_vulgaris",
    "Gaidropsarus_mediterraneus",
    "Ciliata_septentrionalis",
    "Ciliata_mustela",
    "Enchelyopus_cimbrius",
    "Urophycis_floridana",
    "Urophycis_regia",
    "Urophycis_brasiliensis",
    "Urophycis_chuss",
    "Urophycis_tenuis",
    "Urophycis_cirrata",
    "Phycis_blennoides",
    "Phycis_chesteri",
    "Phycis_phycis",
    "Raniceps_raninus",
    "Euclichthys_polynemus",
    "Melanonus_gracilis",
    "Melanonus_zugmayeri",
    "Lepidion_guentheri",
    "Lepidion_inosimae",
    "Lepidion_lepidion",
    "Lepidion_eques",
    "Lepidion_schmidti",
    "Lepidion_capensis",
    "Lepidion_ensiferus",
    "Antimora_microlepis",
    "Antimora_rostrata",
    "Halargyreus_johnsonii",
    "Mora_moro",
    "Physiculus_japonicus",
    "Physiculus_natalensis",
    "Physiculus_fulvus",
    "Gadella_jordani",
    "Physiculus_capensis",
    "Gadella_imberbis",
    "Physiculus_rastrelliger",
    "Tripterophycis_gilchristi",
    "Guttigadus_latifrons",
    "Pseudophycis_barbata",
    "Pseudophycis_bachus",
    "Lotella_rhacina",
    "Laemonema_goodebeanorum",
    "Laemonema_barbatulum",
    "Trachyrincus_scabrus",
    "Trachyrincus_murrayi",
    "Squalogadus_modificatus",
    "Muraenolepis_marmorata",
    "Muraenolepis_orangiensis",
    "Muraenolepis_microps"
  ],
  "chronogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Merlucciidae_mrca.tre",
  "phylogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Merlucciidae_mrca_phylogram.tre"
}