{
  "species": [
    "Bonapartia pedaliota",
    "Cyclothone acclinidens",
    "Cyclothone alba",
    "Cyclothone atraria",
    "Cyclothone braueri",
    "Cyclothone kobayashii",
    "Cyclothone livida",
    "Cyclothone microdon",
    "Cyclothone obscura",
    "Cyclothone pallida",
    "Cyclothone parapallida",
    "Cyclothone pseudopallida",
    "Cyclothone pygmaea",
    "Cyclothone signata",
    "Gonostoma atlanticum",
    "Gonostoma denudatum",
    "Gonostoma elongatum",
    "Manducus greyae",
    "Manducus maderensis",
    "Margrethia obtusirostra",
    "Margrethia valentinae",
    "Sigmops bathyphilus",
    "Sigmops ebelingi",
    "Sigmops gracilis",
    "Sigmops longipinnis",
    "Triplophos hemingi"
  ],
  "sampled_species": [
    "Bonapartia pedaliota",
    "Cyclothone acclinidens",
    "Cyclothone alba",
    "Cyclothone atraria",
    "Cyclothone kobayashii",
    "Cyclothone livida",
    "Cyclothone microdon",
    "Cyclothone obscura",
    "Cyclothone pallida",
    "Cyclothone parapallida",
    "Cyclothone pseudopallida",
    "Cyclothone pygmaea",
    "Cyclothone signata",
    "Gonostoma atlanticum",
    "Gonostoma denudatum",
    "Gonostoma elongatum",
    "Margrethia obtusirostra",
    "Sigmops bathyphilus",
    "Sigmops ebelingi",
    "Sigmops gracilis",
    "Sigmops longipinnis",
    "Triplophos hemingi"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Cyclothone braueri",
    "Manducus greyae",
    "Manducus maderensis",
    "Margrethia valentinae"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Cyclothone acclinidens",
      "Cyclothone alba",
      "Cyclothone atraria",
      "Cyclothone kobayashii",
      "Cyclothone livida",
      "Cyclothone microdon",
      "Cyclothone obscura",
      "Cyclothone pallida",
      "Cyclothone parapallida",
      "Cyclothone pseudopallida",
      "Cyclothone pygmaea",
      "Cyclothone signata",
      "Gonostoma atlanticum",
      "Gonostoma denudatum",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra",
      "Sigmops bathyphilus",
      "Sigmops ebelingi",
      "Sigmops gracilis",
      "Sigmops longipinnis"
    ],
    "16s": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Cyclothone acclinidens",
      "Cyclothone alba",
      "Cyclothone atraria",
      "Cyclothone kobayashii",
      "Cyclothone livida",
      "Cyclothone microdon",
      "Cyclothone obscura",
      "Cyclothone pallida",
      "Cyclothone parapallida",
      "Cyclothone pseudopallida",
      "Cyclothone pygmaea",
      "Cyclothone signata",
      "Gonostoma atlanticum",
      "Gonostoma denudatum",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra",
      "Sigmops bathyphilus",
      "Sigmops ebelingi",
      "Sigmops gracilis",
      "Sigmops longipinnis"
    ],
    "4c4": [],
    "coi": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Cyclothone acclinidens",
      "Cyclothone atraria",
      "Cyclothone microdon",
      "Cyclothone pallida",
      "Cyclothone parapallida",
      "Cyclothone pseudopallida",
      "Cyclothone signata",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra",
      "Sigmops bathyphilus",
      "Sigmops longipinnis",
      "Triplophos hemingi"
    ],
    "cytb": [],
    "enc1": [
      "Cyclothone microdon",
      "Cyclothone parapallida",
      "Cyclothone pseudopallida",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra",
      "Sigmops bathyphilus",
      "Sigmops longipinnis",
      "Triplophos hemingi"
    ],
    "ficd": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Gonostoma elongatum"
    ],
    "glyt": [
      "Cyclothone microdon"
    ],
    "hoxc6a": [],
    "kiaa1239": [],
    "myh6": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Cyclothone acclinidens",
      "Cyclothone microdon",
      "Cyclothone pseudopallida",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra",
      "Sigmops longipinnis"
    ],
    "nd2": [],
    "nd4": [],
    "panx2": [],
    "plagl2": [
      "Cyclothone microdon"
    ],
    "ptr": [
      "Cyclothone microdon"
    ],
    "rag1": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Cyclothone acclinidens",
      "Cyclothone microdon",
      "Cyclothone parapallida",
      "Cyclothone pseudopallida",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra",
      "Sigmops bathyphilus",
      "Sigmops longipinnis",
      "Triplophos hemingi"
    ],
    "rag2": [],
    "rhodopsin": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Sigmops bathyphilus"
    ],
    "ripk4": [],
    "sh3px3": [
      "Cyclothone microdon",
      "Gonostoma elongatum"
    ],
    "sidkey": [],
    "sreb2": [],
    "svep1": [],
    "tbr1": [
      "Cyclothone microdon"
    ],
    "vcpip": [],
    "zic1": [
      "Bonapartia pedaliota",
      "Cyclothone microdon",
      "Gonostoma elongatum",
      "Margrethia obtusirostra"
    ]
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Euteleosteomorpha"
    ],
    "division": [],
    "family": [
      "Gonostomatidae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Stomiatiformes"
    ],
    "section": [],
    "series": [],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Stomiatii"
    ],
    "subdivision": [],
    "suborder": [],
    "subsection": [],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Bonapartia pedaliota": 0.0233,
    "Cyclothone acclinidens": 0.0255,
    "Cyclothone alba": 0.0392,
    "Cyclothone atraria": 0.0264,
    "Cyclothone kobayashii": 0.0516,
    "Cyclothone livida": 0.0256,
    "Cyclothone microdon": 0.0433,
    "Cyclothone obscura": 0.0189,
    "Cyclothone pallida": 0.0247,
    "Cyclothone parapallida": 0.0183,
    "Cyclothone pseudopallida": 0.0524,
    "Cyclothone pygmaea": 0.0442,
    "Cyclothone signata": 0.0403,
    "Gonostoma atlanticum": 0.0255,
    "Gonostoma denudatum": 0.0315,
    "Margrethia obtusirostra": 0.0229,
    "Sigmops bathyphilus": 0.0266,
    "Sigmops ebelingi": 0.0296,
    "Sigmops gracilis": 0.0264,
    "Sigmops longipinnis": 0.0274,
    "Triplophos hemingi": 0.0317,
    "Gonostoma elongatum": 0.034
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Bonapartia pedaliota": 0.031,
    "Cyclothone acclinidens": 0.0313,
    "Cyclothone alba": 0.0314,
    "Cyclothone atraria": 0.0314,
    "Cyclothone kobayashii": 0.0314,
    "Cyclothone livida": 0.0314,
    "Cyclothone microdon": 0.0314,
    "Cyclothone obscura": 0.0313,
    "Cyclothone pallida": 0.0313,
    "Cyclothone parapallida": 0.0313,
    "Cyclothone pseudopallida": 0.0314,
    "Cyclothone pygmaea": 0.0314,
    "Cyclothone signata": 0.0314,
    "Gonostoma atlanticum": 0.031,
    "Gonostoma denudatum": 0.031,
    "Margrethia obtusirostra": 0.031,
    "Sigmops bathyphilus": 0.0286,
    "Sigmops ebelingi": 0.0286,
    "Sigmops gracilis": 0.0286,
    "Sigmops longipinnis": 0.0286,
    "Triplophos hemingi": 0.0356,
    "Gonostoma elongatum": 0.0286
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Bonapartia pedaliota": 0.0018,
    "Cyclothone acclinidens": 0.0021,
    "Cyclothone alba": 0.0021,
    "Cyclothone atraria": 0.0021,
    "Cyclothone kobayashii": 0.0021,
    "Cyclothone livida": 0.0021,
    "Cyclothone microdon": 0.0021,
    "Cyclothone obscura": 0.0021,
    "Cyclothone pallida": 0.0021,
    "Cyclothone parapallida": 0.0021,
    "Cyclothone pseudopallida": 0.0021,
    "Cyclothone pygmaea": 0.0021,
    "Cyclothone signata": 0.0021,
    "Gonostoma atlanticum": 0.0018,
    "Gonostoma denudatum": 0.0018,
    "Margrethia obtusirostra": 0.0018,
    "Sigmops bathyphilus": 0.0048,
    "Sigmops ebelingi": 0.0048,
    "Sigmops gracilis": 0.0048,
    "Sigmops longipinnis": 0.0048,
    "Triplophos hemingi": 0.0013,
    "Gonostoma elongatum": 0.0048
  },
  "mean_dr": 0.0313,
  "mean_bamm_lambda": 0.0309,
  "mean_bamm_mu": 0.0026,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/family/Gonostomatidae.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/family/Gonostomatidae.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/family/Gonostomatidae.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/family/Gonostomatidae_phylogram.tre",
  "rogues": [
    "Eustomias_acinosus",
    "Eustomias_filifer",
    "Eustomias_jimcraddocki",
    "Eustomias_furcifer",
    "Eustomias_polyaster",
    "Grammatostomias_flagellibarba",
    "Aristostomias_tittmanni",
    "Aristostomias_scintillans",
    "Aristostomias_polydactylus",
    "Pachystomias_microdon",
    "Malacosteus_niger",
    "Bathophilus_vaillanti",
    "Bathophilus_pawneei",
    "Photonectes_dinema",
    "Photonectes_braueri",
    "Photonectes_margarita",
    "Echiostoma_barbatum",
    "Tactostoma_macropus",
    "Idiacanthus_fasciola",
    "Idiacanthus_atlanticus",
    "Idiacanthus_antrostomus",
    "Melanostomias_margaritifer",
    "Leptostomias_gladiator",
    "Leptostomias_longibarba",
    "Thysanactis_dentex",
    "Flagellostomias_boureei",
    "Odontostomias_micropogon",
    "Trigonolampa_miriceps",
    "Chirostomias_pliopterus",
    "Astronesthes_similus",
    "Borostomias_panamensis",
    "Astronesthes_gemmifer",
    "Neonesthes_capensis",
    "Borostomias_antarcticus",
    "Stomias_gracilis",
    "Stomias_boa_boa",
    "Borostomias_elucens",
    "Rhadinesthes_decimus",
    "Heterophotus_ophistoma",
    "Stomias_atriventer",
    "Stomias_affinis",
    "Astronesthes_macropogon",
    "Phosichthys_argenteus",
    "Chauliodus_sloani",
    "Chauliodus_danae",
    "Chauliodus_macouni",
    "Ichthyococcus_ovatus",
    "Argyropelecus_lychnus",
    "Argyropelecus_aculeatus",
    "Argyropelecus_olfersii",
    "Argyropelecus_sladeni",
    "Argyropelecus_hemigymnus",
    "Argyropelecus_affinis",
    "Argyropelecus_gigas",
    "Maurolicus_walvisensis",
    "Maurolicus_japonicus",
    "Maurolicus_muelleri",
    "Maurolicus_australis",
    "Maurolicus_weitzmani",
    "Polyipnus_matsubarai",
    "Polyipnus_asteroides",
    "Polyipnus_stereope",
    "Polyipnus_kiwiensis",
    "Polyipnus_indicus",
    "Polyipnus_polli",
    "Polyipnus_clarus",
    "Valenciennellus_tripunctulatus",
    "Danaphos_oculatus",
    "Sternoptyx_diaphana",
    "Sternoptyx_pseudobscura",
    "Sternoptyx_obscura",
    "Polymetme_corythaeola",
    "Polymetme_thaeocoryla",
    "Yarrella_blackfordi",
    "Pollichthys_mauli",
    "Diplophos_taenia"
  ],
  "chronogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Gonostomatidae_mrca.tre",
  "phylogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Gonostomatidae_mrca_phylogram.tre"
}