{
  "species": [
    "Centropomus armatus",
    "Centropomus ensiferus",
    "Centropomus medius",
    "Centropomus mexicanus",
    "Centropomus nigrescens",
    "Centropomus parallelus",
    "Centropomus pectinatus",
    "Centropomus poeyi",
    "Centropomus robalito",
    "Centropomus undecimalis",
    "Centropomus unionensis",
    "Centropomus viridis",
    "Hypopterus macropterus",
    "Lates angustifrons",
    "Lates calcarifer",
    "Lates japonicus",
    "Lates lakdiva",
    "Lates longispinis",
    "Lates macrophthalmus",
    "Lates mariae",
    "Lates microlepis",
    "Lates niloticus",
    "Lates stappersii",
    "Lates uwisara",
    "Psammoperca waigiensis"
  ],
  "sampled_species": [
    "Centropomus armatus",
    "Centropomus ensiferus",
    "Centropomus medius",
    "Centropomus mexicanus",
    "Centropomus nigrescens",
    "Centropomus parallelus",
    "Centropomus pectinatus",
    "Centropomus poeyi",
    "Centropomus robalito",
    "Centropomus undecimalis",
    "Centropomus unionensis",
    "Centropomus viridis",
    "Lates calcarifer",
    "Lates japonicus",
    "Lates microlepis",
    "Lates niloticus",
    "Psammoperca waigiensis"
  ],
  "unsampled_species": [
    "Hypopterus macropterus",
    "Lates angustifrons",
    "Lates lakdiva",
    "Lates longispinis",
    "Lates macrophthalmus",
    "Lates mariae",
    "Lates stappersii",
    "Lates uwisara"
  ],
  "gene_sampling": {
    "12s": [
      "Lates calcarifer",
      "Lates niloticus"
    ],
    "16s": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus mexicanus",
      "Centropomus nigrescens",
      "Centropomus parallelus",
      "Centropomus pectinatus",
      "Centropomus poeyi",
      "Centropomus robalito",
      "Centropomus undecimalis",
      "Centropomus unionensis",
      "Centropomus viridis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates niloticus",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "4c4": [
      "Centropomus undecimalis"
    ],
    "coi": [
      "Centropomus parallelus",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates niloticus",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "cytb": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus mexicanus",
      "Centropomus nigrescens",
      "Centropomus parallelus",
      "Centropomus pectinatus",
      "Centropomus poeyi",
      "Centropomus undecimalis",
      "Centropomus unionensis",
      "Centropomus viridis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates niloticus"
    ],
    "enc1": [
      "Centropomus undecimalis"
    ],
    "ficd": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "glyt": [
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates niloticus"
    ],
    "hoxc6a": [
      "Centropomus ensiferus"
    ],
    "kiaa1239": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "myh6": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates microlepis",
      "Lates niloticus",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "nd2": [],
    "nd4": [],
    "panx2": [
      "Centropomus ensiferus"
    ],
    "plagl2": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Lates niloticus",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "ptr": [
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates niloticus"
    ],
    "rag1": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Centropomus viridis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Lates niloticus",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "rag2": [],
    "rhodopsin": [
      "Lates calcarifer",
      "Lates niloticus"
    ],
    "ripk4": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "sh3px3": [
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates microlepis",
      "Lates niloticus",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "sidkey": [],
    "sreb2": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Psammoperca waigiensis"
    ],
    "svep1": [
      "Centropomus ensiferus"
    ],
    "tbr1": [
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates niloticus"
    ],
    "vcpip": [],
    "zic1": [
      "Centropomus armatus",
      "Centropomus ensiferus",
      "Centropomus medius",
      "Centropomus undecimalis",
      "Lates calcarifer",
      "Lates japonicus",
      "Lates microlepis",
      "Psammoperca waigiensis"
    ]
  },
  "taxonomy": {
    "class": [
      "Actinopteri"
    ],
    "cohort": [
      "Euteleosteomorpha"
    ],
    "division": [
      "Euacanthomorphacea"
    ],
    "family": [
      "Centropomidae"
    ],
    "infraclass": [
      "Teleostei"
    ],
    "infracohort": [
      "Eurypterygia"
    ],
    "infraorder": [],
    "megacohort": [
      "Osteoglossocephalai"
    ],
    "order": [
      "Incertae sedis in Carangaria"
    ],
    "section": [
      "Ctenosquamata"
    ],
    "series": [
      "Carangaria"
    ],
    "subclass": [
      "Neopterygii"
    ],
    "subcohort": [
      "Neoteleostei"
    ],
    "subdivision": [
      "Percomorphaceae"
    ],
    "suborder": [],
    "subsection": [
      "Acanthomorphata"
    ],
    "supercohort": [
      "Clupeocephala"
    ],
    "superorder": []
  },
  "tiprates_dr": {
    "Centropomus armatus": 0.0531,
    "Centropomus ensiferus": 0.0626,
    "Centropomus medius": 0.0457,
    "Centropomus mexicanus": 0.0491,
    "Centropomus nigrescens": 0.0347,
    "Centropomus parallelus": 0.0491,
    "Centropomus pectinatus": 0.0457,
    "Centropomus poeyi": 0.0531,
    "Centropomus robalito": 0.0626,
    "Centropomus undecimalis": 0.0531,
    "Centropomus unionensis": 0.0531,
    "Centropomus viridis": 0.0435,
    "Lates calcarifer": 0.067,
    "Lates japonicus": 0.07,
    "Lates microlepis": 0.1014,
    "Lates niloticus": 0.1042,
    "Psammoperca waigiensis": 0.0198
  },
  "tiprates_bamm_lambda": {
    "Centropomus armatus": 0.055,
    "Centropomus ensiferus": 0.055,
    "Centropomus medius": 0.055,
    "Centropomus mexicanus": 0.055,
    "Centropomus nigrescens": 0.055,
    "Centropomus parallelus": 0.055,
    "Centropomus pectinatus": 0.055,
    "Centropomus poeyi": 0.055,
    "Centropomus robalito": 0.055,
    "Centropomus undecimalis": 0.055,
    "Centropomus unionensis": 0.055,
    "Centropomus viridis": 0.055,
    "Lates calcarifer": 0.055,
    "Lates japonicus": 0.055,
    "Lates microlepis": 0.055,
    "Lates niloticus": 0.055,
    "Psammoperca waigiensis": 0.055
  },
  "tiprates_bamm_mu": {
    "Centropomus armatus": 0.0003,
    "Centropomus ensiferus": 0.0003,
    "Centropomus medius": 0.0003,
    "Centropomus mexicanus": 0.0003,
    "Centropomus nigrescens": 0.0003,
    "Centropomus parallelus": 0.0003,
    "Centropomus pectinatus": 0.0003,
    "Centropomus poeyi": 0.0003,
    "Centropomus robalito": 0.0003,
    "Centropomus undecimalis": 0.0003,
    "Centropomus unionensis": 0.0003,
    "Centropomus viridis": 0.0003,
    "Lates calcarifer": 0.0003,
    "Lates japonicus": 0.0003,
    "Lates microlepis": 0.0003,
    "Lates niloticus": 0.0003,
    "Psammoperca waigiensis": 0.0003
  },
  "mean_dr": 0.0569,
  "mean_bamm_lambda": 0.055,
  "mean_bamm_mu": 0.0003,
  "matrix_phylip": "downloads/taxonomy/family/Centropomidae.phylip.xz",
  "matrix_nexus": "downloads/taxonomy/family/Centropomidae.nex.xz",
  "chronogram": "downloads/taxonomy/family/Centropomidae.tre",
  "phylogram": "downloads/taxonomy/family/Centropomidae_phylogram.tre",
  "rogues": [
    "Solea_aegyptiaca",
    "Solea_senegalensis",
    "Solea_solea",
    "Pegusa_impar",
    "Synapturichthys_kleinii",
    "Pegusa_cadenati",
    "Pegusa_lascaris",
    "Solea_ovata",
    "Pegusa_nasuta",
    "Microchirus_variegatus",
    "Monochirus_hispidus",
    "Microchirus_ocellatus",
    "Bathysolea_profundicola",
    "Microchirus_boscanion",
    "Dicologlossa_hexophthalma",
    "Microchirus_azevia",
    "Dicologlossa_cuneata",
    "Buglossidium_luteum",
    "Austroglossus_pectoralis",
    "Austroglossus_microlepis",
    "Zebrias_fasciatus",
    "Zebrias_zebra",
    "Soleichthys_heterorhinos",
    "Pseudaesopia_japonica",
    "Pardachirus_morrowi",
    "Pardachirus_marmoratus",
    "Heteromycteris_japonicus",
    "Synaptura_lusitanica_lusitanica",
    "Cynoglossus_robustus",
    "Cynoglossus_attenuatus",
    "Cynoglossus_oligolepis",
    "Cynoglossus_itinus",
    "Cynoglossus_interruptus",
    "Cynoglossus_kopsii",
    "Cynoglossus_marleyi",
    "Cynoglossus_lingua",
    "Cynoglossus_macrostomus",
    "Cynoglossus_puncticeps",
    "Cynoglossus_lida",
    "Cynoglossus_bilineatus",
    "Cynoglossus_joyneri",
    "Cynoglossus_lighti",
    "Cynoglossus_cynoglossus",
    "Cynoglossus_sinicus",
    "Cynoglossus_browni",
    "Cynoglossus_senegalensis",
    "Paraplagusia_japonica",
    "Aseraggodes_heemstrai",
    "Aseraggodes_kobensis",
    "Samariscus_japonicus",
    "Samariscus_xenicus",
    "Plagiopsetta_glossa",
    "Trinectes_maculatus",
    "Trinectes_inscriptus",
    "Trinectes_paulistanus",
    "Catathyridium_jenynsii",
    "Achirus_declivis",
    "Hypoclinemus_mentalis",
    "Achirus_lineatus",
    "Gymnachirus_texae",
    "Gymnachirus_melas",
    "Samariscus_latus",
    "Samaris_cristatus",
    "Bothus_mancus",
    "Bothus_lunatus",
    "Bothus_pantherinus",
    "Bothus_robinsi",
    "Bothus_ocellatus",
    "Bothus_maculiferus",
    "Bothus_podas",
    "Psettina_tosana",
    "Trichopsetta_ventralis",
    "Asterorhombus_cocosensis",
    "Chascanopsetta_prognatha",
    "Chascanopsetta_lugubris",
    "Chascanopsetta_prorigera",
    "Laeops_kitaharae",
    "Lophonectes_gallus",
    "Arnoglossus_imperialis",
    "Arnoglossus_capensis",
    "Arnoglossus_thori",
    "Crossorhombus_kobensis",
    "Crossorhombus_kanekonis",
    "Arnoglossus_laterna",
    "Japonolaeops_dentatus",
    "Laeops_pectoralis",
    "Laeops_nigromaculatus",
    "Arnoglossus_tenuis",
    "Syacium_micrurum",
    "Syacium_maculiferum",
    "Syacium_gunteri",
    "Syacium_papillosum",
    "Cyclopsetta_panamensis",
    "Cyclopsetta_querna",
    "Cyclopsetta_chittendeni",
    "Symphurus_plagiusa",
    "Symphurus_plagusia",
    "Symphurus_civitatium",
    "Symphurus_ginsburgi",
    "Symphurus_nigrescens",
    "Symphurus_diomedeanus",
    "Symphurus_arawak",
    "Symphurus_tessellatus",
    "Symphurus_atricaudus",
    "Symphurus_ommaspilus",
    "Symphurus_strictus",
    "Symphurus_megasomus",
    "Symphurus_hondoensis",
    "Symphurus_thermophilus",
    "Symphurus_orientalis",
    "Poecilopsetta_beanii",
    "Poecilopsetta_plinthus",
    "Achiropsetta_tricholepis",
    "Neoachiropsetta_milfordi",
    "Mancopsetta_maculata",
    "Platichthys_flesus",
    "Platichthys_stellatus",
    "Liopsetta_pinnifasciata",
    "Kareius_bicoloratus",
    "Pleuronectes_platessa",
    "Pleuronectes_quadrituberculatus",
    "Limanda_ferruginea",
    "Limanda_proboscidea",
    "Lepidopsetta_polyxystra",
    "Lepidopsetta_mochigarei",
    "Lepidopsetta_bilineata",
    "Isopsetta_isolepis",
    "Psettichthys_melanostictus",
    "Parophrys_vetulus",
    "Pseudopleuronectes_yokohamae",
    "Pseudopleuronectes_schrenki",
    "Pseudopleuronectes_obscurus",
    "Pseudopleuronectes_herzensteini",
    "Limanda_limanda",
    "Limanda_aspera",
    "Limanda_sakhalinensis",
    "Cleisthenes_pinetorum",
    "Cleisthenes_herzensteini",
    "Dexistes_rikuzenius",
    "Hippoglossoides_elassodon",
    "Hippoglossoides_robustus",
    "Hippoglossoides_dubius",
    "Hippoglossoides_platessoides",
    "Microstomus_achne",
    "Embassichthys_bathybius",
    "Microstomus_pacificus",
    "Microstomus_kitt",
    "Glyptocephalus_stelleri",
    "Glyptocephalus_cynoglossus",
    "Glyptocephalus_zachirus",
    "Tanakius_kitaharae",
    "Clidoderma_asperrimum",
    "Reinhardtius_hippoglossoides",
    "Eopsetta_grigorjewi",
    "Eopsetta_jordani",
    "Hippoglossus_hippoglossus",
    "Hippoglossus_stenolepis",
    "Lyopsetta_exilis",
    "Verasper_variegatus",
    "Verasper_moseri",
    "Pleuronichthys_verticalis",
    "Pleuronichthys_decurrens",
    "Pleuronichthys_ritteri",
    "Pleuronichthys_coenosus",
    "Pleuronichthys_cornutus",
    "Pleuronichthys_japonicus",
    "Hypsopsetta_guttulata",
    "Citharichthys_gilberti",
    "Citharichthys_arenaceus",
    "Citharichthys_spilopterus",
    "Citharichthys_macrops",
    "Etropus_longimanus",
    "Etropus_crossotus",
    "Citharichthys_stigmaeus",
    "Citharichthys_minutus",
    "Citharichthys_xanthostigma",
    "Citharichthys_sordidus",
    "Etropus_microstomus",
    "Citharichthys_arctifrons",
    "Paralichthys_orbignyanus",
    "Paralichthys_aestuarius",
    "Paralichthys_californicus",
    "Paralichthys_adspersus",
    "Paralichthys_olivaceus",
    "Paralichthys_patagonicus",
    "Paralichthys_squamilentus",
    "Paralichthys_dentatus",
    "Paralichthys_lethostigma",
    "Paralichthys_albigutta",
    "Pseudorhombus_arsius",
    "Pseudorhombus_natalensis",
    "Tarphops_oligolepis",
    "Pseudorhombus_pentophthalmus",
    "Pseudorhombus_malayanus",
    "Pseudorhombus_elevatus",
    "Gastropsetta_frontalis",
    "Ancylopsetta_ommata",
    "Paralichthys_isosceles",
    "Hippoglossina_oblonga",
    "Hippoglossina_stomata",
    "Xystreurys_rasile",
    "Xystreurys_liolepis",
    "Pseudorhombus_oligodon",
    "Atheresthes_stomias",
    "Atheresthes_evermanni",
    "Lepidorhombus_whiffiagonis",
    "Lepidorhombus_boscii",
    "Zeugopterus_punctatus",
    "Phrynorhombus_norvegicus",
    "Scophthalmus_maeoticus",
    "Scophthalmus_maximus",
    "Scophthalmus_rhombus",
    "Scophthalmus_aquosus",
    "Citharus_linguatula",
    "Citharoides_macrolepis",
    "Lepidoblepharon_ophthalmolepis",
    "Brachypleura_novaezeelandiae",
    "Psettodes_belcheri",
    "Psettodes_bennettii",
    "Psettodes_erumei",
    "Sphyraena_picudilla",
    "Sphyraena_sphyraena",
    "Sphyraena_idiastes",
    "Sphyraena_helleri",
    "Sphyraena_borealis",
    "Sphyraena_argentea",
    "Sphyraena_viridensis",
    "Sphyraena_acutipinnis",
    "Sphyraena_japonica",
    "Sphyraena_jello",
    "Sphyraena_putnamae",
    "Sphyraena_barracuda",
    "Sphyraena_guachancho",
    "Sphyraena_ensis",
    "Sphyraena_forsteri",
    "Sphyraena_obtusata",
    "Sphyraena_chrysotaenia",
    "Sphyraena_pinguis",
    "Sphyraena_iburiensis",
    "Sphyraena_flavicauda",
    "Lactarius_lactarius",
    "Caranx_crysos",
    "Caranx_caballus",
    "Caranx_ruber",
    "Caranx_bucculentus",
    "Caranx_heberi",
    "Caranx_lugubris",
    "Caranx_ignobilis",
    "Caranx_papuensis",
    "Caranx_melampygus",
    "Caranx_vinctus",
    "Caranx_caninus",
    "Caranx_latus",
    "Alepes_vari",
    "Alepes_melanoptera",
    "Caranx_hippos",
    "Caranx_sexfasciatus",
    "Carangoides_bartholomaei",
    "Caranx_tille",
    "Gnathanodon_speciosus",
    "Megalaspis_cordyla",
    "Alepes_kleinii",
    "Alepes_djedaba",
    "Atule_mate",
    "Selaroides_leptolepis",
    "Hemicaranx_zelotes",
    "Hemicaranx_leucurus",
    "Chloroscombrus_orqueta",
    "Chloroscombrus_chrysurus",
    "Selene_dorsalis",
    "Selene_peruviana",
    "Selene_setapinnis",
    "Selene_vomer",
    "Selene_brevoortii",
    "Selene_brownii",
    "Carangoides_otrynter",
    "Selene_orstedii",
    "Alectis_alexandrina",
    "Alectis_indica",
    "Alectis_ciliaris",
    "Carangoides_talamparoides",
    "Carangoides_malabaricus",
    "Carangoides_chrysophrys",
    "Carangoides_bajad",
    "Carangoides_gymnostethus",
    "Carangoides_fulvoguttatus",
    "Carangoides_hedlandensis",
    "Carangoides_armatus",
    "Atropus_atropos",
    "Uraspis_secunda",
    "Uraspis_helvola",
    "Uraspis_uraspis",
    "Carangoides_ferdau",
    "Carangoides_orthogrammus",
    "Parastromateus_niger",
    "Carangoides_dinema",
    "Trachurus_longimanus",
    "Trachurus_symmetricus",
    "Trachurus_murphyi",
    "Trachurus_picturatus",
    "Trachurus_trachurus",
    "Trachurus_capensis",
    "Trachurus_trecae",
    "Trachurus_lathami",
    "Trachurus_mediterraneus",
    "Trachurus_declivis",
    "Trachurus_japonicus",
    "Trachurus_novaezelandiae",
    "Trachurus_delagoa",
    "Decapterus_russelli",
    "Decapterus_maruadsi",
    "Decapterus_akaadsi",
    "Decapterus_muroadsi",
    "Decapterus_macrosoma",
    "Decapterus_kurroides",
    "Decapterus_tabl",
    "Caranx_rhonchus",
    "Decapterus_punctatus",
    "Selar_crumenophthalmus",
    "Pseudocaranx_chilensis",
    "Decapterus_macarellus",
    "Selar_boops",
    "Pseudocaranx_wrighti",
    "Pseudocaranx_dentex",
    "Carangoides_equula",
    "Seriola_quinqueradiata",
    "Seriola_lalandi",
    "Seriola_zonata",
    "Naucrates_ductor",
    "Seriola_hippos",
    "Seriola_carpenteri",
    "Seriola_rivoliana",
    "Seriola_fasciata",
    "Seriola_dumerili",
    "Seriolina_nigrofasciata",
    "Elagatis_bipinnulata",
    "Trachinotus_coppingeri",
    "Trachinotus_baillonii",
    "Trachinotus_botla",
    "Trachinotus_africanus",
    "Trachinotus_goreensis",
    "Trachinotus_goodei",
    "Trachinotus_rhodopus",
    "Trachinotus_blochii",
    "Trachinotus_falcatus",
    "Trachinotus_paitensis",
    "Trachinotus_carolinus",
    "Trachinotus_ovatus",
    "Trachinotus_anak",
    "Trachinotus_teraia",
    "Scomberoides_tol",
    "Scomberoides_lysan",
    "Scomberoides_tala",
    "Scomberoides_commersonnianus",
    "Oligoplites_saurus",
    "Oligoplites_saliens",
    "Oligoplites_altus",
    "Parona_signata",
    "Lichia_amia",
    "Coryphaena_equiselis",
    "Coryphaena_hippurus",
    "Rachycentron_canadum",
    "Remora_osteochir",
    "Remora_brachyptera",
    "Remora_remora",
    "Remora_australis",
    "Remora_albescens",
    "Echeneis_naucrates",
    "Echeneis_neucratoides",
    "Phtheirichthys_lineatus",
    "Makaira_mazara",
    "Makaira_nigricans",
    "Istiophorus_platypterus",
    "Istiompax_indica",
    "Kajikia_albida",
    "Kajikia_audax",
    "Tetrapturus_georgii",
    "Tetrapturus_pfluegeri",
    "Tetrapturus_belone",
    "Tetrapturus_angustirostris",
    "Xiphias_gladius",
    "Mene_maculata",
    "Leptobrama_muelleri",
    "Pentanemus_quinquarius",
    "Polydactylus_macrochir",
    "Eleutheronema_rhadinum",
    "Polydactylus_sextarius",
    "Polydactylus_malagasyensis",
    "Filimanus_heptadactyla",
    "Polynemus_paradiseus",
    "Eleutheronema_tetradactylum",
    "Polydactylus_plebeius",
    "Leptomelanosoma_indicum",
    "Polydactylus_octonemus",
    "Polydactylus_virginicus",
    "Polydactylus_approximans",
    "Toxotes_jaculatrix",
    "Toxotes_chatareus"
  ],
  "chronogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Centropomidae_mrca.tre",
  "phylogram_mrca": "downloads/taxonomy/family/Centropomidae_mrca_phylogram.tre"
}